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生物信息学作业实验3
广州大学学生实验报告 开课学院及实验室:生命科学学院 计机楼407 2013年 11 月 15 日 学 院 生命科学学院 年级、专业、班 生物工程10 姓名 学号 实验课程名称 生物信息学 实验三 序列分析与比较 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤;
掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析;
熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析);
了解基因的电子表达谱分析。
二、实验内容
1、归纳对人瘦素 (leptin) 的核酸序列分析的结果,列出主要的分析结果;
2、总结核酸序列分析的基本步骤,相互对比结果,指出应注意的事项。
三、实验步骤
3.1、人瘦素 (leptin) 的核酸序列分析Homo sapiens leptin (LEP), mRNA
NCBI Reference Sequence: NM_000230.2
FASTA?Graphics
Go to:
LOCUS NM_000230 3444 bp mRNA linear PRI 03-NOV-2013
DEFINITION Homo sapiens leptin (LEP), mRNA.
ACCESSION NM_000230
VERSION NM_000230.2 GI:169790920
KEYWORDS RefSeq.
SOURCE Homo sapiens (human)
ORGANISM Homo sapiens
Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCE 1 (bases 1 to 3444)
AUTHORS Lee,J.H., Zhou,L., Kwon,K.S., Lee,D., Park,B.H. and Kim,J.R.
TITLE Role of leptin in Legg-Calve-Perthes disease
JOURNAL J. Orthop. Res. 31 (10), 1605-1610 (2013)
PUBMED REMARK GeneRIF: Leptin might play an important role in Legg-Calve-Perthes
disease pathogenesis.
REFERENCE 2 (bases 1 to 3444)
AUTHORS Fourati,M., Mnif,M., Kharrat,N., Charfi,N., Kammoun,M., Fendri,N.,
Sessi,S., Abid,M., Rebai,A. and Fakhfakh,F.
TITLE Association between Leptin gene polymorphisms and plasma leptin
level in three consanguineous families with obesity
JOURNAL Gene 527 (1), 75-81 (2013)
PUBMED REMARK GeneRIF: Two functional variants in the regulatory region of the
LEP gene are associated with plasma leptin level as a quantitative
trait.
REFERENCE 3 (bases 1 to 3444)
AUTHORS Miranda-Filloy,J.A., Lopez-Mejias,R., Genre,F., C
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