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GOLD分子对接流程作者:豆子学号7月4日 目录配体小分子化合物的准备受体蛋白的准备使用GOLD进行正式分子对接VMD软件将对接结果可视化PPT图片后期处理54321配体小分子化合物的准备1可通过下面几种方法获取TMP甲氧苄啶的mol2文件:从ZINC数据库(/)直接下载化合物mol2//)直接下载化合物mol2)直接下载化合物/)直接下载化合物mol2mol2文件;如果知道化合物的结构式,还可以通过ChemDraw软件先画出其2D结构,保存为cdx格式文件,再利用Chem3D软件打开,另保存为mol2文件;PubChem数据库(/)下载化合物3d.sdf//)下载化合物3
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