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PCR基因定点突变
PCR定点突变是最常用的基因定点突变技术,以PCR为基础的突
变方法优点很多,如突变效率高、可以任意定点诱变、快速简单等。
通过设计含有非特异性配对碱基的引物,再通过PCR将突变位点引入
产物中。PCR定点突变技术具有突变回收率高、可在任何位点引入突
变、材料和试剂容易获得、操作简单等优点,它又可以分为重叠延伸
PCR、大引物PCR等。
1.重叠延伸PCR
重叠延伸PCR是发展最早的PCR定点突变技术。如下图所示,该
技术要使用四条引物。其中引物2和3的突起处代表与模板链不能互
补的突变位点,而这两条引物有部分碱基(包括突变位点)是可以互
补的。因此,分别利用引物1和2,引物3和4进行PCR后,得到的
DNA片段可以通过引物2和3互补的碱基杂交在一起,再在DNA聚合
酶的作用下延伸,就能成为一条完整的DNA片段。最后,用引物1和
4进行扩增得到含有突变位点的DNA片段。通过测序可以检验定点突
变是否成功。
重叠延伸PCR能将突变碱基加入至DNA的内部。但是这种方法往
往需要三轮PCR才能获得产物,过程繁琐。
例1.利用重叠延伸PCR技术进行定点突变可以实现对纤维素酶
基因进行合理性改造,其过程如下图所示。下列分析不正确的是
()
A.PCR1过程中的产物AB是依赖引物a和引物b扩增的结果
B.引物c和引物b上均含有与模板链不能互补的碱基
C.①过程需要先加热至90℃以上后再冷却至50℃左右
D.②过程需要利用引物a和引物d获得突变产物AD
答案:D
2.大引物PCR
由于重叠延伸PCR需要三轮PCR才能获得大量突变DNA,多轮PCR
因引物的改变要将PCR产物进行试管的转移,而这种转移容易造成样
品遭受环境污染。有学者巧妙地设计出只需要两轮PCR即可获得突变
DNA的方法,即大引物PCR法。
大引物PCR需要用到三条引物进行两轮PCR,这三条引物分别是
突变上游引物、常规上游引物和常规下游引物。该技术的流程如图所
示。第一轮PCR利用突变上游引物和常规下游引物进行扩增,得到不
完整的含有突变位点的DNA片段;第二轮PCR利用第一轮扩增产物中
的一条DNA链作为下游大引物,它与常规上游引物一起扩增得到完整
的含有突变位点的DNA片段。
大引物PCR的巧妙之处在于摒弃了在突变碱基上下游分段、分别
PCR的思路,将第一轮PCR出的产物作为第二轮PCR的引物,直接获
得了突变DNA。但是这种方法依旧存在试管转移的问题。可以将第二
轮PCR中下游引物长度设计地比第一轮上游引物长一些,这样就可以
通过适当提高退火温度以抑制上游引物在第二轮中与模板链的结合。
例2.大引物PCR定点突变常用来研究蛋白质结构改变导致的功
能变化。单核苷酸的定点诱变仅需进行2轮PCR反应即可获得,第一
轮加诱变引物和侧翼引物,第一轮产物作第二轮PCR扩增的大引物,
过程如图所示。请分析回答下列问题:
(1)引物结合到互补DNA链时的温度称退火温度,常规PCR设定的
退火温度通常是____。为了使两轮PCR反应在同一支试管中进行,引
物设计时应考虑不同的退火温度,第二轮PCR的退火温度应该比第一
轮____,第二轮PCR仍需加入的引物是____。
答案:55-60℃高(另一种)健翼引物
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