放线菌分类研究进展.ppt

放线菌因菌落呈放线状而 的得名。它是一个原核生物类 群，在自然界中分布很广，主 要以孢子繁殖，其次是断裂生 殖。放线菌在自然界分布广泛 ，主要以孢子或菌丝状态存在于土壤、空气和水中，尤其是含水量低、有机物丰富、呈中性或微碱性的土壤中数量最多，而且具有土壤特有的泥腥味 。 2 放线菌分类地位的演变 早期的放线菌分类系统是以形态性状作 为主要分类标准，在以后的放线菌分类中， 除根据形态和培养性状外，还增加了化学组 分、核酸本质、碱基比例、核酸杂交、辐射 光线反应等。 最早Waksman的放线菌分类系统将放线菌目分为7个科： 分杆菌科、放线菌科、嗜皮菌科、游动放线菌科、小单孢菌 科、链霉菌科和卡氏菌科，之后数十年内放线菌又经历了多 次分科。 我们沿用至今的是2001年出版的《伯杰氏系统细菌学手 则》第二版，它把高G+C含量革兰氏阳性细菌确定为放线菌 门，放线菌归于细菌域、放线菌门、放线菌纲(亚纲)、放线 菌目(亚目)、放线菌科、放线菌属、放线菌种。 3.1 经典分类方法 主要以形态特 征、培养特征及生 理生化特征等表观 分类学指征，对微 生物分类单位进行 的描述分类。 3.2 数值分类 数值分类是通过计算分析大量的特征，一般要 求选择不少于50个实验特征，计算出相似值来考察 菌株间的相互关系，它是建立在计算机应用上的一 种分类方法。 在数值分类中，单一的特征没有分类意义，因 而它能更客观地描述菌株的分类关系。且一旦分类 关系确定后，就可以从中挑选出特征性指标用于菌 株的鉴定。 3.3 化学分类 化学分类是研究微生物细胞不同化学特性， 并利用这些特性对生物个体进行分类和鉴定。 3.4 分子分类 Stackebrandt和Woese在80年代根据16SrRNA 相似性、DNA-rRNA和DNA-DNA杂交的结果，构建 了放线菌和其他生物之间的系统发育树，这标志着 放线菌分子分类时期的开始。随着分子生物学的发 展，分子分类正成为分类学的主要方法。 目前分子分类的主要方 法有：DNA-DNA(rRNA)分 子杂交技术、DNA碱基分析、 16SrRNA寡核苷酸编目分析。 其中16S rRNA寡核苷酸 编目分析法应用于放线菌分 类研究之后，给放线菌分类 体系带来了深刻的变革。 3.5 多相分类 多相分类最早由Colwel提出，可用于所 有分类单位的描叙。多相分类是将表型、基 因型以及系统进化分析 数据综合起来作为分类 和进化分析的依据。 4 国内放线菌分类研究展望 当今放线菌分类已从表观分类发展到多相分类16S rDNA／rRNA是研究细菌及放线菌系统发育，揭示其亲缘关系及分类鉴定必不可少的重要分类指征。以16S rDNA／rRNA特征序列加快了放线菌分类鉴定与新属如放线多形态菌属的发现。只有对它进行更多的研究，微生物分类研究才能对生物科技、生物多样性研究、环境研究作出更大贡献。