海洋药学专业毕业论文--RPE65蛋白质的结构预测.docVIP

海洋药学专业毕业论文--RPE65蛋白质的结构预测.doc

  1. 1、本文档共24页,可阅读全部内容。
  2. 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
  5. 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
  6. 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们
  7. 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
  8. 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
目 录 摘要 ………………………………………………………………………………1 前言 ………………………………………………………………………………2 第一章 背景介绍…………………………………………………………………3生物信息学在蛋白质结构预测中的应用 ………………………………………3 第二章 RPE65基因蛋白概述 ……………………………………………………6 2.1 RPE65基因蛋白的功能………………………………………………………6 2.2 RPE65蛋白质基因的组成…………………………………………………6 第三章 RPE65的3D结构模型预测 ………………………………………………9 3.1 3D-PSSM获得RPE65的初步模型信息 ………………………………………9 3.2 SCWRL软件预测侧链坐标 …………………………………………………10 3.3 Jackal软件包对模型的修饰………………………………………………12 第四章 结果和讨论 ……………………………………………………………14 第五章 视网膜色素变性研究进展 ……………………………………………18 参考文献…………………………………………………………………………20 致谢………………………………………………………………………………21 RPE65蛋白质的结构预测 摘 要 应用生物信息学的方法对蛋白质结构的预测,为进一步研究蛋白质的生物学功能开辟了一个新的领域。本课题的提出是通过生物信息学软件预测蛋白质为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据Abstract Using bioinformatics methods for protein structure prediction opens a new area for further study of protein biological function. The topic proposed by bioinformatics method to predict the natural conformation of RPE65 and its structures, according to obtained three-dimensional structure model of the protein to discuss its function and possible mechanisms. This method also provides a reliable basis for designing new proteins and modified proteins. Keywords:protein structure prediction; retina; RPE65 前 言 视紫红质是感光细胞中的一种视色素,在光线的接收和视觉电位的产生方面具有重要的生理作用,由视紫红质介导的过度光信号传导是光性视网膜变性的主要原因。近年的研究表明,视网膜色素上皮细胞中的RPE65蛋白作为影响视紫红质再生的关键因素,与视网膜光损伤的易感性密切相关[1]。 随着近年来生物信息学的快速发展,我们在该课题中应用生物信息学的研究方法对RPE65蛋白质的结构进行预测。 生物信息学的从蛋白质的氨基酸序列预测蛋白质结构。, 因此进行蛋白质的结构预测对了解未知蛋白生物学功能具有重要意义。 本课题即是通过计算机在Linux系统下获得RPE65蛋白质基因的三维立体结构模型,进而讨论它在视觉周期中所发挥的重要作用。 课题所介绍的计算机模型的研究,其主要过程是通过3D-PSSM服务器获取RPE65基因蛋白的初步三维结构模型,其相应的侧链是从SCWRL中获得。最后,应用Jackal与Charmm力场对初步模型进行修复和完善。根据获得的三维结构模型,对蛋白质功能的可能机制进行讨论。并了解蛋白质功能,为设计新的蛋白质或改造已有蛋白质提供可靠的依据,同时为新的药物分子设计提供合理的靶分子结构以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析生物系统规律是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究基因组学重点主要体现在基因组学(Genomics)和学(Proteomics)两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。1989年在美国举办与的计算机模型国际会议,生物信息学发展到了、计算系统生物学的时代。组织由实验中获取的大量有关生物学的数据即建立相应的数据库,如PDB,Genbank,SwissProtFASTA,PSI-BLAST, 生物信息学的重要研究课题有:大规模基因组测序

文档评论(0)

mkt365 + 关注
实名认证
文档贡献者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档