耐盐碱蛋白K-nhaD2的生物信息学分析.pdfVIP

耐盐碱蛋白K-nhaD2的 生物信息学分析 G13组：王银晓 秦江曼 郭文芳 白净 主要内容 绪论 耐盐碱蛋白K-nhaD2的生物信息学分析 结论 研究背景  土壤盐渍化已成为制约农业生产的一个重要因素， 全球盐碱地已相当严重，目前约9.54亿万公顷，而我 国的盐碱地就将近1亿公顷。同时随着耕地面积逐渐 减少，如何将如此广袤的盐碱地利用到农业生产中 去这一问题越来越受到人们的关注。  目前，盐渍化土地的开发利用主要通过以下两种途 径：一是通过物理化学方法，合理灌溉、淡水冲洗、 施用化学改良药剂来改良土壤，为农作物生长创造 适宜环境；二是利用基因工程、遗传育种技术培育 具有耐盐碱性的新品种。 植物耐盐碱机制 渗透压调节机制 离子区隔化 活性氧的解毒作用 生长调节 转录因子 耐盐碱蛋白K-nhaD2  基因K-nhaD2是从大自然中多种耐盐细菌中 分离得到的一个耐盐碱基因。目前，已利用 基因工程技术将其转化到大肠杆菌中，并验 证了其编码的蛋白质K-nhaD2生物学功能具 有强耐盐碱性。但是它的耐盐碱机制的作用 机理目前还没有明确。 现在，我们将利用生物信息学方法预测其表 达蛋白的耐盐碱机制，为进一步利用基因工 程技术得到强耐盐碱的植物新品种打下坚实 基础。 主要内容 绪论 耐盐碱蛋白K-nhaD2的生物信息学分析 结论 序列分析 Accession E value Max ident Source HQ585057.1 0.0 100% Bacterium enrichment culture clone K2 CP003466.1 0.0 77% Alcanivorax dieselolei B5 HQ585056.1 0.0 77% Bacterium enrichment culture clone K1 CP003171.1 2e-163 75% Oceanimonas sp. GK1 AM 167899.1 1e-160 76% Halomonas elongata DSM 2581 CP002607.1 4e-95 72% Aeromonas veronii B565 CP000606.1 1e-91 72% Shewanella loihica PV-4, CP000644.1 4e-86 72% Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 转 AY962404.1 8e-63 71% Alkalimonas amylolytica 运 蛋 白 以上分别进行了核酸和蛋白序列（U