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对结构基因的具体转录方式是不对称转录(asymmetric transcription),它有两方面含义:在DNA分子双链上,一股链用作模板指引转录,另一股链不转录;其二是模板链并非总是在同一单链上。 DNA依赖的RNA聚合酶催化合成RNA; RNA合成的化学机制与DNA依赖的DNA聚合酶催化DNA合成相似。合成方向5’-3’。 DNA聚合酶在启动DNA链延长时需要引物存在,而RNA聚合酶不需要引物就能直接启动RNA链的延长。 RNA聚合酶和DNA的特殊序列——启动子(promoter)结合后,就能启动RNA合成。 真核生物具有3种不同的RNA聚合酶: RNA聚合酶Ⅱ最大亚基的羧基末端有一段共有序列(consensus sequence)为Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser的重复序列片段,称为羧基末端结构域(carboxyl-terminal domain, CTD)。 CTD对于维持真核细胞中的转录是必需的。 一、转录起始 每一个转录区段可视为一个转录单位,在原核生物中被称为操纵子(operon)。操纵子包括若干个结构基因及其上游(upstream)的调控序列。 1、启动子 调控序列中的启动子是RNA聚合酶结合模板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。 原核生物以RNA聚合酶全酶结合到DNA的启动子上而起动转录,其中由σ亚基辨认启动子,其他亚基相互配合。 E.coli的转录起始和延长 第一个磷酸二酯键生成后,σ亚基即从转录起始复合物上脱落,核心酶连同四磷酸二核苷酸,继续结合于DNA模板上,酶沿DNA链前移,进入延长阶段。 Electron micrograph demonstrating that translation occurs concomitantly with transcription 依赖Rho 因子的转录终止 不依赖Rho因子的转录终止 ρ因子是由相同亚基组成的六聚体蛋白质,亚基分子量46kD。 ρ因子能结合RNA,又以对poly C的结合力最强。 ρ因子还有ATP酶活性和解螺旋酶(helicase)的活性。 目前认为,ρ因子终止转录的作用是:与RNA转录产物结合,结合后ρ因子和RNA聚合酶都可发生构象变化,从而使RNA聚合酶停顿,解螺旋酶的活性使DNA/RNA杂化双链拆离,利于产物从转录复合物中释放 。 真核生物转录生成的mRNA分子是初级RNA转录物(primary RNA transcript,hnRNA) 经过加工而来。 加工主要在细胞核中进行。 帽子结构: 帽子结构的意义: 可以使mRNA免遭核酸酶的攻击; 也能与帽结合蛋白质复合体(cap-binding complex of protein)结合,并参与mRNA和核糖体的结合,启动蛋白质的生物合成。 尾部修饰是和转录终止同时进行的过程。 poly A的有无与长短,是维持mRNA作为翻译模板的活性,以及增加mRNA本身稳定性的因素。 一般真核生物在胞浆内出现的mRNA,其poly A长度为100至200个核苷酸之间,也有少数例外。 小结 不对称转录 RNA聚合酶 启动子概念 原核生物转录大概过程 真核生物的断裂基因、内含子、外显子概念 真核mRNA的转录后加工 tRNA的转录后加工 rRNA的转录后加工 二、 转录延长 1. ?亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移; 2. 在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。 (NMP) n + NTP ?? (NMP) n+1 + PPi 转录空泡(transcription bubble): RNA-pol (核心酶) ···· DNA ···· RNA 5? 3? DNA 原核生物转录过程中的羽毛状现象 核糖体 RNA RNA聚合酶 在同一DNA模板上,有多个转录同时在进行; 转录尚未完成,翻译已在进行。 这种形状说明: 原核生物转录与翻译同步进行的现象 三、转录终止 转录终止指RNA聚合酶在DNA模板上停顿下来不再前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来。 依据是否需要蛋白质因子的参与,原核生物转录终止分为: 1、依赖ρ因子的转录终止 ρ因子: ρ因子的作用原理: 序列中有富含CA的rut元件 2、不依赖 Rho因子的转录终止 DNA模板上靠近终止处,有些特殊的碱基序列(使转录产物富含G/C的回文序列和一连串的U序列),转录出RNA后,RNA产物形成特殊的结构来终止转录。 5`UUGCAGCCUGACAAAUCAGGCUGAUGGCUGGUGACUUUUUAG
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