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第三章 蛋白质(protein) 第三章 蛋白质(protein) (123-317页 第3,4,5,6,7章) 第一节 氨基酸—蛋白质的构件分子 第二节 蛋白质通论与结构 第三节 蛋白质结构与功能的关系 第四节 蛋白质的性质、分离与纯化 第一节 氨基酸—蛋白质的构件分子 (二)氨基酸的分类 1、根据侧链R基团是否有极性 非极性氨基酸 Ala 、Val、 Ile、 Pro、 Phe、 Trp、 Met 极性氨基酸 不带电极性:Gly Ser Thr Cys Tyr Asn Gln 带负电:Asp Glu 带正电:Lys Arg His 2、根据分子中氨基与羧基数目 酸性氨基酸:Asp Glu 碱性氨基酸:Lys His Arg 中性氨基酸:15种 3、根据人和哺乳动物所需氨基酸是否能自身合成 必需氨基酸:Lys Val Met Try Leu Ile Thr Phe 半必需:Arg His 非必需:其余10种 不常见的氨基酸:4-羟基脯氨酸 5-羟基赖氨酸 (由常见的氨基酸经修饰而来的) 非蛋白质氨基酸:150余种 特殊氨基酸的总结 唯一一个无手性碳、无旋光性的氨基酸 :Gly 唯一一个亚氨基酸、与茚三酮反应生成黄色物质的氨基酸:Pro 含有巯基,在空气中易氧化生成二硫键的氨基酸:Cys 在生物合成中是一种重要甲基供体的氨基酸:Met 在大多数酶的活性中心都发现有其残基的氨基酸:Ser 在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸:His 碱性最强、在生理条件下完全质子化的氨基酸:Arg 含有两个手性碳的氨基酸:Thr Ile 在近紫外区有吸收的氨基酸:Trp Tyr Phe 能够发生Millon反应的氨基酸:Trp 能够发生Pauly反应的氨基酸:His 能够发生坂口反应的氨基酸: Arg 等电点的计算 1.侧链不解离的中性氨基酸 pI = ( pK1 + pK2 )/2 2.侧链含有可解离基团的氨基酸 酸性氨基酸 pI = ( pK1 + pKR2 )/2 碱性氨基酸 pI = ( pK2 + pKR3 )/2 半胱氨酸 pI = ( pK1 + pKR2 )/2 酪氨酸 pI = ( pK1 + pKR2 )/2 注意:pKa的数值选公式中代入的质子供体和质子受体之间的解离子数。 (四)氨基酸的化学反应 1.α- 氨基参加的反应 与亚硝酸反应 与酰化试剂反应 烃基化反应 生成西佛碱的反应 脱氨基反应与转氨基反应 2,4-二硝基氟苯 (DNFB或FDNB,Sanger试剂) 苯异硫氰酸酯 (PITC, Edman试剂) 用于鉴定多肽或蛋白质的N端氨基酸及序列测定 2.α-氨基和α-羧基共同参加的反应 (1)与茚三酮的反应 (2)氨基酸的两性解离 (3)形成肽键 (4)离子交换反应 茚三酮在弱酸性溶液中与氨基酸共热,所有具有游离氨基氨基酸都生成紫色化合物(?570)。 脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应直接生成的是黄色化合物(?440)。 应用:是一个检测和定量氨基酸和蛋白质的重要反应。 用层析法把各种氨基酸分开后,利用茚三酮显色可以定性测定各种氨基酸。 3.侧链R基参加的反应 (1)酪氨酸的酚基 米伦反应(Millon) 与HgNO3、Hg(NO3)2、HNO3作用呈红色;与浓硝酸作用生成黄色。 Pauly反应 与重氮化合物反应生成橘黄色化合物。 注: His的咪唑基与重氮化合物反应生成棕红色 (2)精氨酸的胍基 坂口反应(Sagakuchi) 与次氯酸钠(或次溴酸钠)及α-萘酚在氢氧化钠溶液中产生红色产物。 (3)Cys侧链上的巯基(-SH) 与卤化烷生成稳定的烷基衍生物------可保护 -SH 以防被氧化 Cys巯基打开氮丙啶的环 巯基能和各种金属离子形成络合物----SH 酶遇到重金属离子而生成硫醇盐时,将导致酶失活 巯基易受空气或其他氧化剂氧化-两种氧化衍生物 形成二硫化物:胱氨酸的形成 形成磺酸基:对游离的巯基具有保护作用,保护Cly巯基之间的氧化。 (五)氨基酸的光学活性和光谱性质 氨基酸的旋光性 氨基酸的光谱性质 在280nm处有最大吸收峰 可见光区都没有光吸收 在远紫外区和红外区都有光吸收 近紫外区(220~400nm)只有酪氨酸(275nm)苯丙氨酸(257nm)和色氨酸(280nm)有吸收。这是紫外吸收法测定蛋白质含量的基础。 (六)氨基酸混合物的分离和分析 分配层析法的一般原理 纸层析 柱层析 离子交换层析 气液层析 薄层层析 高效(压)液相层析HPLC 二、
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