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mRNA差异显示方法研究进展.doc
目的:应用荧光标记的mBNA差异显示技术。
方法:提 取未经过/经过IFN、LPS处理的三组人单核细胞系U937的总RNA并以此为模板,采用荧光标 记的锚定引物,通过逆转录、差异显示PCR反应,经5.6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离差 异条带,回收后将其再扩增。结果:三组样本的 DD-PCR产物电泳显示长30 0 bp~2.0 kb不等的扩增片段,条带清晰、明亮,背景低,各样本相互间的差异不仅呈有 无的变化,亦表现出很多强弱改变;再扩增条带锐利、单一。结论:在本试 验室成功应用了荧光标记差异显示技术,可快速、敏感、经济有效地筛选各种未知的表达基 因。 中图分类号: Q781文献标识码: B 文章编号:1000-6834(200 0)04-0373-04FLUORESCENT mRNA DIFFERENTIAL DISPLAY TECHNIQUEWANG Gang-shi (Department of Gastroenterology General Hospital of Chinese PLA , Beijing 100853;) WANG Meng-wei (Department of Gastroenterology General Hospital of Chinese PLA , Beijing 100853;) YOU Wei-di (Department of Gastroenterology General Hospital of Chinese PLA , Beijing 100853;) WANG Hong-fan g ( Institute of Zoology,Chinese Academy of Science, Beijing 100080) FENG Mei-fu ( Institute of Zoology,Chinese Academy of Science, Beijing 100080) ABSTRACT Aim: To apply fluorescent mRNA differential display technique.Met hods: Total RNA samples were extracted from human monocyte line U937 treat cd/untreated with IFN and LPS, and were used as templates in differential displa y PCR. The anchored primers used were labeled with the fluorescent tag. After ru nning on 5.6% denaturing PAGE gel, differentially expressed bands were excised a nd recovered, and finally reamplified. Results: Three tested samples all showed amplified bands differed from 300 bp to 2.0 kb, the bands were brigh t and clear, the background was low. Both yes/no changes and upregulated/downreg ulated happenings were shown simultaneously. The reamplification bands were shar p and pure. Conclusion: We have successfully practiced fluorescent differential display technique in our lab. It is a fast, safe and cost-effecti ve method used to sereen unknown expressed genes. KEY WORDS: differential display; RNA; messenger ; fluorescence mRNA差异显示技术(differential display,DD)是用于研究基因的差异表达的新方法。该技术自1992年[1]]被首次报道后,即以其不可替代的优势被广泛应用于生物医学 领域。在应用过程中不断得到改进[2],并产生了诸多衍生技术如RPA(RNA finger printing by arbitrarily primed PCR)、GDD(ge
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