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实验二质粒DNA的制备.ppt
实验二 质粒DNA的制备 一、实验目的 学习并掌握基因工程操作技术中最常用的载体质粒DNA 的提取方法。 二、实验原理 在碱性溶液中,双链DNA氢键断裂,DNA双螺旋结构遭破坏而发生变性,但由于质粒DNA分子量相对较小,且呈环状超螺旋结构,即使在高碱性pH条件下,两条互补链也不会完全分离,当加入中和缓冲液时,变性质粒DNA 又恢复到原来的构型;而线性的大分子量细菌染色体DNA则不能复性,与细胞碎片、蛋白质、SDS等形成不溶性复合物,通过离心沉淀,细胞碎片、染色体DNA及大部分蛋白质等可被除去,而质粒DNA及小分子量的RNA则留在上清液中,再用酚/氯仿处理,可去除残留蛋白质,混杂的RNA可用RNA酶(RNAase)消除。 三、实验材料与主要试剂 实验材料:含质粒的大肠杆菌DH5α 主要试剂: 溶液I:50 mM葡萄糖,10 mM EDTA,25 mM Tris-HCl(pH8.0),用前加溶菌酶4 mg/L; 溶液II:NaOH溶液(内含1% SDS):0.2 M; 溶液III(pH4.8): 60 mL 5 mol/L醋酸钾,11.5 mL 冰醋酸,28.5 mL H2O; 饱和酚/氯仿/异戊醇(25:24:1) 氯仿 TE缓冲液(pH8.0): 10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA,其中含RNA酶(RNaseA): 20 μg/ml 醋酸铵(pH7.5~8.0): 7.5 mol/L 异丙醇;70%乙醇;无水乙醇。 四、实验步骤 1) 吸取1.4 ml菌液至1.5 ml离心管中。 2) 离心(8 000rpm,1分钟),弃上清液。(如想提取多一点DNA,再吸取1.4 ml菌液至同一离心管中,离心,弃上清液) 3) 加入150 μL 溶液Ⅰ,用旋涡振荡器充分悬浮菌体。 4) 加入200 μL溶液Ⅱ,加盖后温和颠倒5~6次,直至呈透明状。此步骤在5分钟内完成。 5) 加入150 μL预冷的溶液Ⅲ,加盖后反复颠倒混匀,直至出现白色絮状沉淀,冰浴5分钟。 6) 离心(14 000rpm,10分钟,4 ℃),移取上清液于另一干净离心管。 7) 向上清液中加等体积的苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),振荡混匀抽提,离心(14 000 rpm,5分钟),溶液将出现分层。 8) 移取上层水相溶液(约450μL)于另一干净离心管,加等体积氯仿,振荡混匀抽提,离心(14 000 rpm,5分钟),溶液将出现分层。 9)移取上层水相溶液于另一干净离心管,加入1/10体积的醋酸钠(pH5.2)和2倍体积无水乙醇混匀,冰浴30分钟。 10) 离心(14 000rpm,10分钟,4℃),倒掉上清液。 11) 加0.5 ml 预冷的70% 酒精振荡,洗DNA沉淀一次,离心5 分钟,倒掉上清液。 12)真空抽干或室温自然干燥 13)加30~40μL TE缓冲液使DNA完全溶解,室温放置10分钟,降解RNA杂质,琼脂糖凝胶电泳或-20℃保存备用。 14)琼脂糖凝胶电泳(1%):称取0.5g琼脂糖粉末,加入50ml 0.5倍TBE溶液,加热熔化,稍降温后,加入5μL溴化乙锭(EB),混匀,制备凝胶板,冷却后备用。 15)每位同学各取5μL质粒DNA加入1μL 6×loading buffer混匀,进行点样。 16)电泳条件:120v,25分钟;电泳完成后,胶块通过凝胶成像系统检测,观察实验结果,并拍照记录。 五、实验结果 观察并分析电泳图片 * *
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