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论转录组的研究方法及当前进展.doc
论转录组的研究方法及当前进展 郑忠巧 转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有 RNA 的集合。本文对转录组的研究方法及当前进展作了一个综合论述 2013年6月25日 论转录组的研究方法及当前进展
郑忠巧On the transcriptome research methods and current progress
ZhengZongqiao
(The first class of Biotechnology , College of Life Science, Heilongjiang University, Harbin, 150080)
Abstract: the transcriptome is a particular tissue or cell in a certain developmental stage or function state all the set of RNA transcription. Transcriptome research to research from the overall level of gene function and gene structure, reveal the specific molecular mechanism in the process of biological processes and disease. Transcriptome analysis of research methods. Research platform with rapid changes, at the same time, the content of the bioinformatics analysis has also been gradually perfected. In this paper, the research methods and the current progress of the transcriptome made a comprehensive review.
Key words: the transcriptome, SAGE, MPSS, RNA - Seq, methods and characteristics.
转录组的定义
遗传学的研究对象由少量基 因及其功能转变为生物体的全基因组结构、基因功能、表观修饰、细胞调控等, 遗传学研究进入了基 因组和后基因组时代。其中, 通过细菌基因组和转 录组研究来揭示生命基本过程, 如生命形成、生物 进化、基础代谢、疾病发生、药物靶点等, 成为生物学研究的重要手段。广义转录组(Transcriptome)系指从一种细胞或者组织的基因组所转录出来的RNA的总和,包括编码蛋白质的mRNA和各种非编码RNA(rRNA,tRNA,snoRNA,snRNA,microRNA 和其他非编码RNA等)。狭义转录组系指所有参与翻译蛋白质的mRNA 总和。
研究转录组的原因四、转录组的研究进展参考文献: LU BingXin; ZENG ZhenBing; SHI TieLiu. Comparative study of de novo assembly and genome-guided assembly strategies for transcriptome reconstruction based on RNA-Seq(J). Science China(Life Sciences).2013(02).
所在教师班级:马春泉
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