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各种DNA提取方法.pdf
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各种DNA 提取方法
一,基因组DNA 提取方法
制备基因组DNA 是进行基因结构和功能研究的重要步骤,通常要求得到的
片段的长度不小于100-200kb。在DNA 提取过程中应尽量避免使DNA 断裂和
降解的各种因素,以保证DNA 的完整性,为后续的实验打下基础。主要是CTAB
方法,其他的方法还有1 物理方式:玻璃珠法超声波法研磨法冻融法。2 化学方
式:异硫氰酸胍法碱裂解法3 物方式:酶法。根据核酸分离纯化方式的不同有:
硅质材料、阴离子交换树脂等
试验步骤:
1、贴壁细胞用胰酶消化,离心收集。
2、细胞重悬于冰冷的PBS 漂洗 次,离心收集。试验步骤2 再重新作
边。
3、加入5mlDNA 提取缓冲液,(10mmol/LTris-cl0.1mol/LEDTAo.5%SDS)
混匀。
4 、加入25ul 蛋白酶K 使终浓度达到100ug/ml 混匀,50℃水浴3h
5、用等体积的酚抽提 次,2500rpm 离心收集水相,用等体积的 (酚,氯
仿,异戊醇)混合物抽提 次,2500r/min 离心收集水相
6、用等体积的氯仿,异戊醇抽提 次。加入等体积的5mol/L 的LiCL 混匀,
冰浴,10min.。
7、2500rpm 离心10min.转上清于 离心管中。加入等体积的异丙醇。室温
10min。
2500rpm 离心10min。弃上清。
8、加入0.1 倍体积3mol/L 乙酸钠(PH5.2)与2 倍体积-20℃预冷无水乙醇。
-20℃20min。
9、12000r/min 室温离心5min。弃上清。将DNA 溶于适量TE 中。
二,外周血DNA 提取技术
分离外周血白细胞提取方法:
试验步骤:
1、取人肘静脉血5ml,EDTA 抗凝,2500rpm 离心10min。
2、小心吸取上层血浆,分装到3 个0.5ml 离心管中。
3、在血细胞中加入3 倍体积的溶血液,摇匀,冰浴15min。
4 、2500rpm 离心10min,弃上清。
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5、加入10ml 溶血液,摇匀,冰浴15min。
6、3000rpm 离心10min,弃上清。
7、倒置离心管,去掉残液。
8、得白细胞,-80℃冻存。
试验要求:
血至分离白细胞之间隔时间在室温下放置不超过2h,4 ℃放置不超过5h,
以防白细胞自溶。
三,氯仿法抽提外周血白细胞基因组DNA:
试验试剂:
Ligsisbuffer :
133mMNH4ClNHCl7.12g0.9mMNH4HCO3NH4HCO30.071g0.1mMEDTA
0.5mMEDTA0.2ml;最后加灭菌去离子水至1000ml,高压灭菌。
ACD 抗凝剂:柠檬酸1.68g 柠檬酸钠4.62g 葡萄糖5.15g;最后加灭菌去
离子水至350ml,高压灭菌。
提取缓冲液(Extractionbuffer ):
10mMTrisCl(PH=8.0)1MTris.Cl(PH=8.0)1ml0.1mMEDTA(PH=8.0)0.5mM
EDTA(PH=8.0)20ml0.5%SDS10%SDS0.5ml;最后加灭菌去离子水至100ml,
高压灭菌
试验步骤:
1、在500 l 抗凝血中加入ligsisbuffer1000 l,充分颠混至清亮。以4000rpm,
离心5min。弃上清液。
2、沉淀中加入ligsisbuffer1500 l,充分匀浆。以6000rpm,离心5min。
3、彻底弃去上清,加入extractionbuffer500 l (裂解细胞),混匀置于37
℃,水溶1h。
4 、加入8 l 的蛋白酶K,颠混,37℃过夜 (或55℃,3h,但是37℃效果
要好些)。
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