用离散量预测原核生物蛋白质的亚细胞位置.pdfVIP

年 月 内蒙古大学学报 自然科学版 !# $ % * !# ’() 第 卷第 期 #+ , *#+ *, -./0’.1(2/10345 60/4307145 8219(3:1/0/1:6(1;2=7 7 6 文章编号?@A@B#C%!#,D,@DC 用离散量预测原核生物蛋白质的亚细胞位置E 陈颖丽 李前忠 F 内蒙古大学理工学院物理系 内蒙古 呼和浩特 % F @!@ 摘要 基于不同亚细胞位置中蛋白质的氨基酸组成及序列信息不同这一观点 以单个氨基酸 ? F 含量及两两组合氨基酸含量为信息构成离散源 分别计算了原核生物蛋白质三类亚细胞位置 F 的标准离散量 % 利用离散增量的概念预测蛋白质的亚细胞位置 它是由 F % F % * F I J K G H G H G H 这个蛋白质的离散量 与三个标准离散量 之间离散增量的最小值 % % F % F % I J K G H G H G H G H 所决定的 采用 D 检验和 D 检验方法 给出了选择五组不同信息作为离 * ’(7L.2:1:/(2.M N0.OO21L( F 散源中参数时的预测结果 与现有的方法比较 发现用 检验法预测 类 * F D N0.OO21L( (P/30.(774703 蛋白质时 给出的离散量方法能够给出最好的预测性能 结果也表明提取更多有效的序列信息 F F 是提高预测精度的关键* 关键词 蛋白质亚细胞位置 原核生物 离散量 离散增量 ? Q Q Q 中图分类号? B@ 文献标识码? R - 引 言 近年来 随着数据库中新的蛋白质序列的迅猛增加 我们正面临着一个挑战 能否应用生物信息 F F ? 学的研究来帮助促进蛋白质结构和功能的测定 因为大量的序列数据无法及时用实验的方法验证 蛋 S