真核生物DNA非编码区的组分分析.pdfVIP

； （） 生物化学与生物物理进展 · · ## % , ’()+,-)./01+,-)/4+ 7$9 * 23 真核生物!#非编码区的组分分析 ） ） ） ） ） ! ! ! ! 刘 蓉 齐 震 朱小蓬 凌伦奖 韩汝珊 ） ） ! （北京大学物理系，北京 ； 中国科学院生物物理研究所，北京 ） !##$%! !##!#! 摘要 在全基因组水平上，用直方图、混沌表示灰度图、距离差异度和信息熵差异度四种方法，研究了拟南芥、 线虫、果蝇的 内含子、基因间隔区 、外显子三种区域的核苷酸短序列组分及组分复杂度 结果表明： ’( ’( ) 不同基因组之间，不管基因数目多少，用 种方法得到的外显子部分其组分复杂度都比较接近，而非编码区 *+ , 部分的组分复杂度却很大)这一点定量地说明了物种之间的复杂程度，主要不体现在编码区部分，而体现在非 编码区部分 同一基因组中，内含子的核苷酸短序列组分复杂度都是相似的，外显子和 部分 )-+ ./0121/.4’( 3 的组分复杂度也是相似的 内含子和 在转录、剪切、二级结构等方面有很大的不同，但它们在 )4+ ./0121/.4’( 3 核苷酸短序列组分上的差异却很小，说明内含子和./0121/.4’(在转录、剪切、二级结构上的不同并不通过核 3 苷酸短序列组分来进行限制) 关键词 非编码区，生物复杂性，碱基组分，距离差异度，信息熵差异度，混沌表示 学科分类号 5% 高等真核生物，特别是人的基因组中，非编码 所有数据序列的总和称为该种区域的全集，而各染 区占了 对非编码区的研究是后基因 色体或 的相应序列称为该种区域的子集 考 678!6%8) 4;/0. ) 3 ［ ］ 组时代的巨大挑战!!9 )而非编码区研究，一个 察核苷酸短序列，即由 、 、 、 ， 个字母组 ( @ A B , 最基本的工作就是它的碱基组分分析 以前对碱基 成的字串 比如：长度为 的字串有 ， )