细粒棘球绦虫原头蚴mRNA测序及表达谱分析.pdfVIP

中国人兽共患病学报 2015，31(1) Chinese ofZoonoses 2l Journal DOI：10．3969／cjzj．issn．1002—2694．2015．01．005 细粒棘球绦虫原头蚴mRNA测序及表达谱分析 巨 巍1’3 艳1’2～，李子华1’3，王娅娜h3，赵嘉庆1’3，朱明星1～，李君良h3，赵 摘 要：目的 通过对细粒棘球绦虫原头蚴的mRNA的测序及表达谱分析，初步建立起细粒棘球绦虫原头蚴的表达谱数 据库，了解细粒棘球绦虫原头蚴基因表达及蛋白构成情况，为全面了解细粒棘球绦虫原头蚴生物学特征及寄生虫与宿主之间 的关系奠定基础并为新的诊断方法、筛选新的药物靶点和疫苗候选分子选择提供理论依据。方法 用TRIZOL法提取人源 物信息学分析。结果 测序结果去杂后得到2G数据，通过从头拼接我们得到18 71329 618 bp，contig平均长度为384bp，最小的contig长度为201bp，最大contig长度为4bp，N50(覆盖50％所有核苷酸的 最大序列重叠群的长度)为384bp。预测得到unigene为9029条，将这9 有7441条unigene具有同源比对信息。结论根据G0分析可以发现，共有lO550条unigene与数据库中的基因有较高同 550条对应关系。通过与KEGG数据库进行比对分析，细粒 源性，且较多的unigene可以与多条基因相对应，一共建立了10 棘球绦虫原头蚴的转录组中有4731条unigene得到注释，这4731个得到注释的基因位于241条代谢通路中，这些代谢通路 分别与代谢过程，基因信息过程，环境相关过程，细胞过程及与人类疾病相关。 关键词：原头蚴；转录组学；生物信息分析；表达谱 中图分类号：R383．3 文献标识码：A 文章编号：1002—2694(2015)01一0021—05 mRNA and characteristicofEc矗Z咒DcoccMs transcriptome grn聆“ZDs比s sequencing JUYanl忽3，LIZi—hual～，ⅥANGYa-nal～，ZHAO Weil’3 Jia—qin91～，ZHUMing-)【in91～，LIJu”lian91～，Zhao (1． CP舡fPr MPdifnZ D，MPdifnZSfiP行fP，Ni粗gzinUnit旭rs“y，yj”c^“Ⅱ”750004，C^幻{(【； 2． DisPnsPs Ni”gziⅡCP玎￡ers．厂orPrPuP玎fio”CorroZ，YI”f^“口”750004，C矗in； n”dCeZZ 3。DP户nrf，nPHfo，GP九已fif5 BioZogy，Ning上i(￡MPdifnZU九iuer5i￡y，yinf^“仅月750004，C矗i力口) ofthis wastoestablish databaseof and Abstract：The expressionpro“1e protoscolexcompre— objectivestudy pr