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2017-08-17 发布于江西
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一种面向基因与疾病关系的文本挖掘方法.pdf

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第40卷第3期东南大学学报(自然科学版) V01．40No．3 2010年5月 JoURNALoFSoIrTl哑ASTI『NⅣERSrrY(N咖ralScienceEditjon) 2010 May doi：10．3969／j．issn．100l一0505．2010．03．010 一种面向基因与疾病关系的文本挖掘方法龚乐君1，2 韦有兵1 谢建明1 袁志栋1 孙啸1 (1东南大学生物电子学国家重点实验室，南京210096) (2淮阴工学院计算机工程学院，淮安223003) 摘要：结合模式匹配、生物医学本体及共现技术，设计了一种自动抽取基因与疾病、基因与基因之间关系的文本挖掘方法，并开发了一个可以处理海量文本数据的系统．该系统可抽取与疾病相关的基因实体，挖掘基因与疾病、基因与基因之间的关系，衡量基因与疾病实体的相关性，并为分析基因与疾病、基因与基因之间的关系提供了网络可视化工具．实验结果表明，系统在测试数据集上抽取基因与疾病之间的关系可获得83．0％的综合测评率，抽取基因与基因之间的关系可获得78．5％的综合测评率．该系统已成功应用于乳腺癌及相关基因的研究．关键词：生物医学；文本挖掘；关系抽取；实体识别中图分类号：TP391文献标志码：A 文章编号：100l一0505(2010)03旬486旬5 Text f．0r betweenanddiseases miIlingapproachrelationshipsgenes Wei Xie YuaIl SunXia01 GongLejunl，2 Youbin91JiaJlIIlin91 Zhidon91 Statc I (1 l(eyaborat0巧ofBioclec仃0nics，Southe雒tUIliversity，N删ing210096，Cllina) Schoolof III嘶tIltcof (2 C鲫putcrEngin∞ring，HuaiyinTcchnology，Huai彻223003，ChiM) text is for between Abstract：A relationships IIlining印proachdesignedautomaticallyextracting吐le between matchandbiomedical aIlddise嬲esaIldmose genes genes锄dgenesbycombiningpanem wimco—occurrence a is for text deVeloped ontology techniques．Andsystem processingla唱e—scale to between dataSetS．Thecanexmactent“iesrelated me system gene di