分子进化树中的模糊问题研究.pdfVIP

2008年 青海师范大学学报(自然科学版) 2008 of Normal No．1 Journal 第1期 Qinghai University(NaturalScience) 分子进化树中的模糊问题研究 阎锡海，陈彤 (龙岩学院生物科学与工程系，福建龙岩364000) ． 摘要：分子树是生物进化论、分子进化论研究的重要内容之一．本文根据分子生物学研究成就，就分子树由研究材料的局限 性、研究方法的特殊性、研究结果的简单性引起的模糊问题进行了研究． 关键词：分子树；生物大分子；生物进化；序列；模糊问题；分子生物学 中豳分类号：S533 文献标识码：A 文章编号：1001—7s42120呕)01．0052一晒 tree0f 分子树(a molecule)又称分子系统树 亚第四纪冻土层中发现的猛犸象(Mammuthus (molecularsystemtree)，它是20世纪50年代之后， 生物学家用生物化学方法，对不同物种同源蛋白 珀中发现的昆虫外【2，副，其他古生物中的生物大 质氨基酸或核酸核苷酸组成差异序列所反映出的 分子在化石形成过程中，被岩层中的无机分子所 亲缘关系、进化地位、分歧时间而绘制出的树状图 置换或所破坏，几乎未留下有意义信息【4】，这极大 谱．它是进化论、分子进化论研究取得的重要成 的限制了生物学家对生物的分子进化研究和分子 就，是对生物进化论发展做出的重要贡献．笔者曾 树的构建，他们无奈的只能从现存生物的生物大 撰文就“分子树在进化论研究中的作用”进行过论 分子获得信息，并从获得的信息分析推断生物大 述…． 分子进化的历史，确定生物之间的亲缘关系、分歧 分子进化论中模糊问题研究是生物进化论研 时间、绘制分子进化系统树． 究的重要内容，研究生物进化论中的每一模糊问 可见，分子树是以现存生物同源大分子信息 题，对生物进化论的发展都有促进作用．生物进化 为主要依据绘制成的，它是通过树状形式对生物 论发展到迄今，生物学家可用同源生物大分子排 进化进行的反映，虽然从分子树中可以看出生物 列序列差异信息绘制分子系统树，可使人们对分 从低等到高等进化的现象，但笔者认为它所反映 子系统树中的生物种类的亲缘关系、分歧时间、进 出的生物进化具模糊性．主要表现在：第一，分子 化情况能给予直观的、整体、清晰的认识，但笔者 树是以现存生物同源大分子信息为主要依据绘制 认为，分子树中存在着一些需亟待解决的模糊问 的树状结构。生物大分子是分子进化树产生的基 题，通过研究解决，可使人类对分子树予以更加客 础，研究生物大分子的分子生物学，虽然在证明 观、正确、全面、深刻的认识，进行这方面研究，对 生物进化中具不可忽视的作用，但它远不及古生 分子树、生物进化论、分子系统学的发展具积极作 物化石的作用．生物学家普遍认为，古生物化石是 用． 迄今研究、证明生物进化最宝贵、最重要、最主要 的材料，其它材料起一种辅助作用，而古生物化石 1研究材料的局限性导致分子树的模糊 在证明生物进