ITS在区分疑似黄鹌菜上应用.docVIP

吉 首 大 学 JISHOU UNIVERSITY 2010届毕业论文 题 目：学 生 姓 名： 学 号20064074006 学 院： 生物资源与环境科学学院 专 业 年 级： 06级生物 指 导 教 师： ?布拉提白 写 作 时 间： 2010年5月 目 录 摘 要 ………………………………………………………………………………………………….1 关键词……………………………………………………………….….………………………………...1 Abstract………...………………………………………………...……………………………………….1 Key words………………………………………………………………………………………………….2 前言 ………………………………………………………………..………………………………….2 1材料和方法：……………………………………………………………………………………………3 1.1 材料….………………..……………………………………………………………………………….3 1.1.1 材料来源………………………………………………………………………………………….3 1.1.2 主要试剂………………………………………………………………………………………….3 1.2 方法………………….……………………………………………………………………………….3 1.2.1 实验材料的采集、洗涤与称量………………………………………………………………….3 1.2.2 样品总DNA的制备……………….…………………………………………………………….3 1.2.3 样品rRNA基因ITS序列PCR扩增.………….……………………………………………….4 1.2.4 ITS序列分析…………………………………………………………………………………….4 2 实验结果………..…………………………………………………………………………………….4 2.1.黄鹌菜和异叶假福王草总DNA的制备…………………………………………………………….4 2.2 ITS序列扩增结果…….…………………………………………………………………………….5 2.3 序列及结构分析结果…..…………………………………………………………………………….5 2.4 同源性分析………….……………………………………………………………………………….7 3 讨论……………..…………………………………………………………………………………….8 参考文献..………………………………………………………………………………………………….9 ITS在区分疑似黄鹌菜上的应用 作者：余玉良 指导老师：恩特马克·布拉提白 （吉首大学生物资源与环境科学学院 中国吉首416000） 摘 要：本研究通过ITS序列对四种菊科植物进行了同源性分析。首先采用改良CTAB法提取总DNA，利用通用引物ITS5和ITS4）经PCR扩增出ITS序列并进行测序。在NCBI数据库中对测序结果进行同源性比对，调取同源性较高的ITS序列，通过聚类分析软件构建进化树。结果表明,四组样品5.8S rDNA序列显示高度的一致性。多态性位点大部分分布于ITS1和ITS2中，且ITS1中的多态性位点高于ITS2。基于ITS序列的系统发育树表明，聚类分析结果与形态学分类结果一致，说明ITS可以作为菊科植物种属、居群间的聚类分析指标。 关键词：菊科；福王草；黄鹌菜；PCR；ITS序列 Aplication of ITS on Distinguishing Seeming Youngia japonica YU Yu-liang Supervisor: Entomack Borrathybay (College of Biology and Environmental Science， JiShou University， JiShou， China， 416000) Abstract: Homology analysis of ITS Sequences from Paraprenanthes prenanthoides and Youngia japonica on Western Hunan. Total DNA were exstracted with using the method of CTAB，ITS fragments was amplified using PCR with specific ITS5 and ITS4，and then sequenced. H