鸡visfatin基因第9内含子4个SNPs关联分析.pdfVIP

20lO，VOLUME12，N0．1ANIMALB10TECHNOLOGYBULLETIN 9 鸡visfatin基因第9内含子4个SNPs的关联分析 韩瑞丽1～，康相涛2，魏杨2，李转见1，蓝贤勇1，陈宏1+ (1西北农林科技大学动物科技学院，陕西省农业分子生物学重点实验室杨凌712100； 2河南农业大学牧医工程学院，河南省家禽种质资源创新工程研究中心郑州450002) 引言 离并鉴定出新的脂肪凶子命名为内脏脂肪素(visfatin)，简称内脂素，序列分析显示内脂素 即为PBEF。从2005年发现visfatin以来，国内外众多学者对其进行了多方面的研究，最多的 研究集中在visfatin作为一个脂肪细胞因子，具有降低血糖、模拟胰岛素作用，调节脂代谢的 功能研究。但这些年的研究表明其分泌、生理、病理作用还不十分明确，故需进行更深入的 研究。鉴于此，本文对其进行SNP位点的检测及其与经济性状的关联分析，以期为进行鸡脂 肪代谢相关指标的标记辅助选择打下基础。 材料方法 对河南农大建立同始鸡×安卡鸡资源群体F2共860只个体，通过DNA测序和RFLP．PCR进 段。SNPl．SNP4PCR产物分别用风Ⅱ、BoxI、脚红、NdeI酶切，根据酶切结果判断基冈型。 锁不平衡分析。SPSS软件GLM过程对不同基因型对鸡生长、屠宰、脂肪、血液生化指标做 关联分析。 结果 单倍型，占到了17．38，频率大于1％的单倍型共有12种，CTAA和TTGA为稀少的单倍型， 频率低于1％。连锁不平衡分析发现4个SNP之间不具有强的连锁不平衡(r20．8且D’ 0．3)。单位点的关联分析表明，SNPl与鸡的初生重、6周体重、8周体重、屠体重及皮下 脂肪厚显著相关，SNP2与4周重，4周胫长、4周胸骨长显著相关，SNP3与初生重、8周 胸骨长，8周骨盆宽，8周体重、腿肌重显著相关，SNP4与4周、12周骨盆宽和皮下脂肪 厚显著相关(氏0．05)。 讨论 以进行了单突变位点与鸡生产性状的关联分析，尽管这4个SNPs位于内含子区域，不属于 基因的编码区，但从相关分析的结果可知，4个SNP分别与鸡的体尺指标、不同周龄的体 重及个别屠宰、脂肪性状相关。SNPl与鸡不同阶段的体重有显著相关，SNP2似乎与鸡的 早期生长有关，SNP3与鸡的8周生长指标相关，SNP4则与4，12周的骨盆宽有关。SNPl 和SNP4与鸡皮下脂肪厚有显著相关，这对于生产中脂肪性状的选择具有重要意义。本研究 也提供了证据，即内含子突变也会通过不同的调节方式影响到畜禽的生产性状。但目前大多 研究得出SNP多具有群体特异性，至于能否作为一个有意义的分子辅助选择标记用于生产， 还有待于在更多的群体里进行验证。 农业科研专项(No．nyhyzx07-039) ·通讯作者。