光敏色素B基因（PHYB）启动子突变及与大白菜开花时间的关联分析.pdfVIP

誊 一 Onlines 虢虢髓 皴 ～ 装ystem：http：w／w／wjaboitechorggy 函-■譬曩 光敏色素B基因(朋 YB)启动子突变及与大 白菜开花时间的关联分析 刘栓桃 张志刚 李巧云 王淑芬 赵智中’卢金东 张晓燕 徐文玲 刘贤娴 付卫民 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所，山东省设施蔬菜生物学重点实验室，国家蔬菜改 良中心山东分中心，济南250100 通讯作者，zhaozhizhong454@163．com 摘 要 光敏色素B(phytochromeB，PHYB)是植物光周期依赖开花途径的关键调控因子之一。本研究 对极端晚花和早花大 白菜(BrassicarapaL．ssp．pekinensis)自交系06—247与Hel02的PHYB全基因组序列 进行了生物信息学分析 。结果表 明，二者全长分别是5986和5528bp，均与数据库中Chiifu一401的同源 序列有不同程度的差异，表明二者均是大 白菜PHYB基因的突变体，并命名为BraphyBl(GenBank登录号： KJ866947)和BraphyB2(GenBank登录号：KJ866948)。二者之 间有 476个插入／缺 失(Inserts／Deletions， InDels)~[157个SNPs。启动子区有473个InDels和31个SNPs、编码区有3个InDels和26个SNPs。InDels 主要体现为p 2在启动子区、5’非翻译区和编码区分别缺失445、18和3bp。phyB2启动子缺失的445 bp中包含两个TATABOX4和两处成髓细胞血症 (myeloblastosis，MYB)类转录因子结合基序，一处GA响 应元件 。开发了鉴定phyB1p／hyB2中445bpInDel突变的共显性标记phyB1．762p／hyB2．317，用该标记检 测 了以06—247与Hel02为亲本杂交构建的F：群体，利用F：代群体植株对抽薹开花时间与标记进行了关联 分析，结果表明，phyB1—762p／hyB2—317分别与晚花／早花表型显著关联(P0．05)。荧光定量RT-PCR显示， PHYB基因在Hel02各个发育阶段的表达水平均显著低于06．247(P0．01)。上述结果表 明，大 白菜PHYB 基因启动子InDel是造成PHYB基因表达差异和开花期改变的主要原因之一。本研究为系统研究PHYB 基因在转录、翻译、蛋 白结构等水平突变对大 白菜开花时间影响的分子机制提供了线索。 关键词 大 白菜，光周期依赖，开花期，PHYB启动子，突变 AssociationAnalysisBetweenPhytochromeBGene(朋 YB)Promoter MutantionsandFloweringTimeinChinesecabbage(BrassicarapaL． ssp．pekinensis) LIUShuan—Tao ZHANGZhi—Gang LIQiao—Yun Ⅵ，ANGShu—Fen zHAOZhi—Zhong LUJin·Dong ZHANG Xiao—Yan XU Weln—Ling LIU Xian—Xian FU Weli—Min VegetableandFlowerInstitute，ShandongAcademyofAgficulutralSciences，ShandongKeyLaboratoryforBiologyofGreenhouseVegetables， ShandongBranchofNationalImprovementCenterforVegetables，Jinan250100，China Correspondingauthor,zhaozhizhong454@163．com Abstract PhytochromeB (PHYB)isoneofkeyfactorsregulatingphotoperiod—dependentfloweringin plant．Atpresentstudy,wholegenomicsequencesofPHYB，whichwereisolatedfrom extremely late—and early—boltingChinesec