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二次通用旋转组合设计优化辣椒SRAP-PCR反应体系.pdfVIP

二次通用旋转组合设计优化辣椒SRAP-PCR反应体系.pdf

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园 艺学报201l,38(增刊):2578 http://删alas.ac.cn ActaHorticulturaeSinica 26.corn E-mail:yuanyixuebao@1 应体系 谈 敏1,张其安2,,刘童光1,,江海坤2 (1安徽农业大学园艺学院,合肥230036;2安徽省农业科学院园艺研究所,合肥230031) 二次通用旋转组合设计是在正交回归组合设计的基础上发展而来,具有旋转性,能使与试验中 心点距离相等的试验点上的预测值方差相等,易于得到组合的最优反应体系。本试验中应用二次通 用旋转组合设计方法,对得到的数学模型进行分析,以期获得最佳的辣椒SRAP反应体系,为辣椒 的分子研究提供技术参考。 参试辣椒材料均由安徽省农业科学院园艺研究所提供。品种‘H.119’用于SRAP.PCR反应体 系的优化研究,18个自交系用于SRAP.PCR反应体系的检验。PCR反应程序为:94℃3mill;94℃l 1 min。35℃lrain,72℃1.5min,5个循环;94℃lmin,5012rain,72℃1.5min,33个循环; 72℃7min,4℃保存。PCR产物采用8%聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳缓冲液为1×TBE,100V恒 电压电泳2.5h。按条带数、清晰度及背景对32个组合设计的电泳条带进行打分,取2次得分的平 均值,应用DPS数据处理软件对结果进行分析。 0.359X3Xs+0.203X4Xs。 方差分析结果表明,回归方程显著性检验R=3.39在0.1水平上差异极显著,但是失拟检验^= 12.17在O.1水平上差异极显著,说明未控制因素对试验的影响很大,回归模型与实测值不能较好地 拟合,所以不能直接用模型进行优化分析。为此,采用计算机对不同水平的组合进行模拟试验,以 零水平的均值7.94为临界值,获得大于临界值的方案2602个,在95%的置信区间均值大于7.94的 mmol·L~,dSZPs(X3) 优化方案为:raq聚合酶(X1)用量0.465~0.49U,M92+(x2)2.264—2.298 0.189—0.211 mmol·L-1,引物(X4.)0.789~0.8ll ng。 U,MgZ+ 结合实验室移液枪的实际条件,将优化方案定为:在lo¨L反应体系中Taq聚合酶用量o.5 浓度2.3mmol·L.1,dNTPs浓度0.2mmol·L一,引物浓度0.8 ng。进 Imaol·L_1,模板DNA用量45 一步将18个不同的辣椒材料用不同引物组合对优化体系稳定性检验,结果表明该体系可靠稳定,适 用于辣椒SRAP分子标记的研究。 关键词:辣椒;二次通用旋转组合设计;S黜心;反应体系 i)S一2578-01 中圈分类号:S641.3 文献标识码:A 文章编号:0513.353X(201 投稿日期:2011一∞一眈 ·通信作者(FAmil.-也叫鹊i舡劬@yah∞.姗;Tel:0551-5160817)

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