ClassⅠ与ClassⅡ新城疫病毒微型基因组的构建及比较.pdfVIP

中国畜牧兽医学会禽病学分会第十五次学术研讨会论文集 两株ClassI新城疫病毒的全基因组序列测定及分析 孟春春，仇旭升，徐丹，陈鸿军，于圣青，丁铲 (中国农业科学院上海兽医研究所禽传染病实验室，上海20024) 新城疫(NewcastleDisease，ND)是一种烈性传染后送上海生工生物工程公司测序。应用DNAStar和 病，对养禽业的危害极大，世界动物卫生组织(OIE)MEGA4分别对测序结果进行比对分析。 将其列为须报告的传染病(2005年之前将其列为A 【结果与讨论】 17 类传染病)。该病的病原，新城疫病毒(Newcastle测序结果表明。JS…6 Go和JS．2．10．Du株的基 disease vires，NDV)在分类上属于副粘病毒科、副粘因组总长度为15198nt，符合“六的倍数”规则。与 病毒属，是单股、负链、不分节段的RNA病毒，基因 DE．R49／99、NDV08．004等ClassI毒株的全基因组长 组结构为3’．NP．P-M．F．HN．L-5’。新城疫病毒只有度相同，在P基因495位后有12个核苷酸的插入， GAGACG I 一个血清型，但根据遗传进化距离分析。目前可以分 插入序列为“TGG GGG”与已报道的Class 为I类(ClassI)和II类(Class II)两个遗传分支。I类毒株插入序列相同。 主要存在于野生水鸟和水禽中，绝大多数都为低致 全基因组的之间同源性比较显示本研究中分离 病性分离株；II类新城疫病毒主要存在于家养禽类 株与第一株获得全序列的ClassI毒株DE．R49／99 中，是造成世界范围内新城疫流行的主要病原。目 的同源性最高，达97．8％，与常用疫苗株I_“Sota之间 前国内外对II类新城疫病毒研究较多，而对于I类 的同源性仅72．6％。根据F基因绘制遗传进化树， 17 10 新城疫病毒研究则相对较少。 结果显示JS…6 Go和JS…2Du在分类上同属于 Class 【材料与方法】 I中的基因2型，根据全基因序列和其他5个 17 毒株：JS…6 Go，2009年分离自健康种鹅群；结构基因绘制的遗传进化树与其基本一致。显示了 Js．2．10．Du，2010年分离自健康种鸭群。两株病毒F新城疫病毒的进化是一个整体的过程。 基因高变区遗传进化分析表明其属于ClassI的基 参考文献 因2型。交叉血凝实验表明，JS．2．10．Du与LaUra存 [1】 Mtmir，A．一M．L．M．，s．z．K．S．h．c．Bade，and 在较大血清学差异。 L．R．m．M．Berg。 of virus characteriaationa Newcastledimisolated Completegenome 用Trizol试剂抽提病毒RNA，6nt随机引物进行 f