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DNA序列分类数学模型.pdf
( )
第 20 卷 第 2 期 《新疆师范大学学报》自然科学版 . 20, . 2
V o l N o
2001 年 6 月 Journal of X injiang N o rm al U niversity Jun. 2001
( )
N atural Sciences Edition
DNA 序列分类数学模型
蒋利平 叶 青 宋军锋 杨锦华
(新疆师范大学数理信息学院, 乌鲁木齐, 830054)
( )
摘 要 本文利用统计的方法先对以某些碱基特别丰富 稀少 作为特征研究DNA 序列结构, 再利
用某些频率较高的片段对序列结构进行进一步的研究, 从而得到了更为有效的判断标准。
关键词 序列 分类 模型 碱基
DNA
( )
中图分类号 141. 4 文献标识码: 文章编号:2001
O A
1 问题的提出
对 20 个已知类别的 序列, 寻找 、 序列的某些特征, 构造分类方法, 从而对未知
DNA A B
序列进行分类。
2 模型假设
( )
2. 1 以某碱基 片断 的概率为标准, 以概率的20% 为浮动范围, 在此范围内称为“常态”。
高于此范围称“优态”低于此范围称为“劣态”。
2. 2 统计中允许省略某些细节。
3 基本模型
3. 1 问题分析:
在给定的 、 两类序列中, 首先对 、、、, 四种碱基的含量进行统计结果如下:
A B a c g t
g t a c
( )
A 类 1~ 10 40 以上 20 以下 30 左右 20 以下
( )
B 类 11~ 20 15 以下 50 以上 30 左右 15 以下
收稿日期: 2001- 3- 28
( )
·6 · 新疆师范大学学报 自然科学版 2001 年
统计结果表明: 类中碱基 的含量很大, 碱基 的含量相对较少; 在 类中
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