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DNA序列分类数学模型.pdf

( ) 第 20 卷 第 2 期 《新疆师范大学学报》自然科学版 . 20, . 2 V o l N o 2001 年 6 月 Journal of X injiang N o rm al U niversity Jun. 2001 ( ) N atural Sciences Edition DNA 序列分类数学模型 蒋利平  叶 青  宋军锋  杨锦华 (新疆师范大学数理信息学院, 乌鲁木齐, 830054) ( ) 摘 要 本文利用统计的方法先对以某些碱基特别丰富 稀少 作为特征研究DNA 序列结构, 再利 用某些频率较高的片段对序列结构进行进一步的研究, 从而得到了更为有效的判断标准。 关键词  序列 分类 模型 碱基 DNA ( ) 中图分类号  141. 4  文献标识码:   文章编号:2001 O A 1 问题的提出 对 20 个已知类别的 序列, 寻找 、 序列的某些特征, 构造分类方法, 从而对未知 DNA A B 序列进行分类。 2 模型假设 ( ) 2. 1 以某碱基 片断 的概率为标准, 以概率的20% 为浮动范围, 在此范围内称为“常态”。 高于此范围称“优态”低于此范围称为“劣态”。 2. 2 统计中允许省略某些细节。 3 基本模型 3. 1 问题分析: 在给定的 、 两类序列中, 首先对 、、、, 四种碱基的含量进行统计结果如下: A B a c g t g t a c ( ) A 类 1~ 10 40 以上 20 以下 30 左右 20 以下 ( ) B 类 11~ 20 15 以下 50 以上 30 左右 15 以下 收稿日期: 2001- 3- 28 ( ) ·6 · 新疆师范大学学报 自然科学版 2001 年   统计结果表明: 类中碱基 的含量很大, 碱基 的含量相对较少; 在 类中

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