84个茶树品种遗传多样性及亲缘关系的SSR分析_王旭.pdfVIP

第 37 卷第 3 期 湖南农业大学学报( 自然科学版) Vol.37 No.3 2011 年 6 月 Journal of Hunan Agricultural University (Natural Sciences) Jun．2011 DOI:10.3724/SP.J.1238.2011.00260 84 个茶树品种遗传多样性及亲缘关系的 SSR 分析 王旭，董丽娟，段继华，李赛君，张曙光 (湖南省农业科学院 茶叶研究所，湖南 长沙 410125) 摘 要：利用 33 对多态性 SSR 引物对 84 个茶树品种进行亲缘关系和遗传多样性分析，并基于 SSR 数据，对供 试品种进行 UPGMA 遗传相似性聚类分析。结果表明：参试品种具有较高的遗传多样性(共检测到 94 个等位位点， 每个引物 2 ～4 个，平均 2.85 个；引物多态性信息含量为 0.20 ～0.79 ，平均值为 0.56 ；可观测等位位点数最多 9 个，最少 3 个，平均 4.79 个；杂合度观测值为 0.08 ～0.97 ，平均值为 0.53 ；杂合度期望值为 0.14 ～0.86 ，平均值 为 0.62 ；群体内的 Shannon 指数平均值为 1.17)；聚类分析结果显示，阿萨姆茶等 6 个品种各自形成了单独的分支， 其余 78 个品种聚成 1 个大类群，在相似系数 0.54 处，这个大类群又可分为 6 个亚类群。 关 键 词：茶树；遗传多样性；亲缘关系；简单重复序列；非加权组平均法 中图分类号：S571.1 文献标志码：A 文章编号：1007− 1032(2011)03−0260−07 Genetic diversity and relationship of 84 tea cultivars (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) by SSR markers WANG Xu, DONG Li-juan, DUAN Ji-hua, LI Sai-jun, ZHANG Shu-guang (Tea Research Institute, Hunan Academy of Agriculture Sciences, Changsha 410125, China) Abstract ：The 33 pairs of simple sequence repeats (SSR) primers were used to analyze the genetic polymorphism and genetic relationship of 84 tea cultivars. Totally 94 alleles were amplified using 33 SSR primers, the number of alleles per primer ranged from 2 to 4, averaged 2.85. The polymorphism information content (PIC) varied from 0.20 to 0.79, averaged 0.56. The observed heterozygosity (Ho) ranged from 0.08 to 0.97 and the expected heterozygosity varied from 0.14 to 0.86, averaged 0.53 and 0.62, respectively. The Shannon index of all accessions is 1.17. All of the results showed that the genetic polymorphism of all accessions were relatively abundant. The 84 accessions were class