蛋白质多肽链机构学模型的建立和应用.pdfVIP

机械设计与研究 2009年增刊 MachineandResearch Design 蛋白质多肽链机构学模型的建立及应用 张红亮，李立 (西南交通大学，成都610031，E-maihzhl820615@hotmail．com) 摘要：将机构学的方法引入蛋白质多肽链的研究，建立起蛋白质多肽链的机构学模型，并以该模型为基础，对蛋白质多肽 链的运动学进行了研究。多肽链运动学对蛋白质空间结构和蛋白质折叠的研究具有重要意义。开辟了用机构学方法解决生物 学问题的新途径。 关键词：蛋白质；多肽链；机构学：正运动学 中图分类号：TP24；Q51 文献标识码：A TheEstablishmentand ofMechanismModelfor Chain Application Polypeptide ZHANG Li Hong-liang，LI (SouthwestJiaotongUniversity,Chengdu610031，China) Abstract：ThemechanismmethodiSin订oducodtotheresearch chaintoestablishamechanismmodelfor ofproteinpolypeptide pro． tein chain．Basedonthe kinematicsof model，the chain,whichis to structureand polypeptide proteinpolypeptide importantprotein studied．This anoveltosolvethe themethodsofmechanism． folding，is studyprovidesway biologicalproblemsby chain；mechanisms；kinematics Keywords：protein；polypeptide 蛋白质是细胞组分中含量最为丰富、功能最多的高分子 l蛋白质多肽链的机构学模型 物质，在生命活动过程中起着各种生命功能执行者的作用， 几乎没有一种生命活动能离开蛋白质，蛋白质是生命的物质 1．1多肽链分子结构 基础。蛋白质的生物学功能取决于它的空间结构【1~3l，通过 氨基酸是含有氨基和羧基的一类有机化合物的通称，是 研究蛋白质的空间结构就可以了解并控制蛋白质的生物学 蛋白质的基本组成单位。如图1所示，构成蛋白质的氨基酸 功能，进一步设计出具有新型生物功能的蛋白质。这对医药、 含有一个氨基、一个羧基、一个氢原子和一个侧链R基团， 农牧业等领域具有非常重要的意义【41。 并且四部分同时与op,t1,Nn一碳原子通过共价键相连接。与 目前，用于蛋白质空间结构研究的方法都是基于生物学 a一碳原子相连的氨基和羧基分别称为口一氨基和口一羧基。 的方法，如分子动力学等理论方法和X光衍射和核磁共振等． H O H O 实验方法。这些方法都存在一些问题：分子动力学方法计算 量过大；实验方法花费时间长，且受技术和设备制约。因此， 叫卜苎{：唧一P一伽