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·104· 第二部分 分子系统学、进化与资源评价
畜禽保种群体遗传多样性的模拟研究
鲁云风,王 明,王茜,黄文波,史利华,吴克亮。
(中国农业大学动物科学与技术学院,国家畜禽遗传育种工程实验室,北京 100193)
引言
畜禽品种资源是畜牧生产的基础,为畜牧生产水平的提高的贡献大约在40%-60%,但是目前畜禽品种资源却
面临巨大的挑战,全球约有30%的畜禽品种处于濒危灭绝的危险。畜禽遗传资源保种的目标就是最大化地保护其
遗传多样性,即在特定的时间内(FAO的标准是50年)保种群体的遗传多样性丢失最少。该研究根据现行畜禽保种
群体采用的保种技术措施和微卫星分子标记的特点,应用计算机模拟技术,模拟研究畜禽保种群体在保种时间内
群体遗传多样性的变化,为畜禽保种群体遗传多样性的最大化保护提供理论支持。
材料与方法
采用计算机模拟技术,根据微卫星标记特点,选择30个标记位点,假设位点均匀分布于基因组,每个位点具有
丰富的多态性,有4-10个等位基因;模拟产生的畜禽保种群体按照现行的保种技术措施进行保种,即群体的公母
比例为1:5、随机交配、各家系随机等量留种、群体规模保持世代恒定,世代间无重叠,保种群体有效大小分别为
Ne=50和Ne=100,保种繁殖30个世代,5次重复。
采用平均等位基因数、多态性位点数、观测基因杂合度、期望杂合度等作为遗传多样性度量指标。
结果
保种群体的遗传多样性总体趋势是随着保种世代而逐渐降低,但是不同群体规模遗传多样性的降低速度是不
同的。
基因丢失;多态性位点从基础群的30个,降至30世代的26.40,即12%的多态性位点变成了单态性位点;观测杂合
度从基础群的0.84,降低至0.38,降幅达到54.76%,期望杂合度从基础群的0.82降低至0.38,降幅达到53.65%。
的基因丢失;但多态性位点各世代均为30个;观测杂合度和期望杂合度分别下降了27.38%和26.51%。
讨论与结论
畜禽保种群由于群体规模有限。保种群体的遗传多样性会随保种时间的推进而逐渐降低,本模拟结果说明当
保种群体规模较小时。遗传多样性的降低速度会比较快,有的遗传多样性指标下降的幅度还相当大,这与(鲁绍雄
等,20lo)模拟结果中群体规模较大则基因杂合度较高相符合。这主要是由于群体规模越小,遗传漂变的效应越大,
当群体规模达到一定临界值时遗传漂变对于群体遗传结构的作用是第一位,选择、突变以及迁移等因素都不能拮
抗遗传漂变的作用(FalconerMackay,1996;Oldenbroek,2007)。
根据研究结果.畜禽资源的遗传多样性要得到有效的保护,首先应该拥有一个保种群体,而且保种群体的规模
是遗传多样保护的关键和制约因素。
关键词:遗传多样性;保种;畜禽品种资源;计算机模拟
致谢:国家“十一五”科技支撑项目(2008BADB2801)。
·通讯作者,E-mail:liangkwu@cau.edu.曲o
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