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猪CCKAR基因+471C/G位点的遗传多态性分析
彭兴1,谭岳华2,黄生强卜
湖南农业大学动物科学技术学院,湖南长沙4101282;
2.广西扬翔农牧有限责任公司,广西贵港537100)
引言
达到了90%以上。本研究以杜洛克、大白、长白、杜长大(D啪以及湖南省四个地方品
种:宁乡猪、大围子猪、沙子岭猪、桃源黑猪和海南地方猪五指山猪共9个品种/群体为
步研究CCKAR基因与猪肉质性状和生长性状的关联分析提供理论基础。
材料与方法
本研究中的试验猪为益阳农科所种猪场和正虹种猪场提供,共计9个品种/群体687头
猪。其中地方品种包括宁乡猪22头、桃源黑猪133头j大围子猪72头、沙子岭猪69头,海
南五指山猪65头:外来品种含杜洛克猪94头、大白猪104头、长白猪69头、杜长大猪59
头。采取供试猪耳组织并提取其DNA。
根据GenBank
下游引物R’:CATCCTCTTGl]盯CGAATCAGC。采用PCR.RFLP方法分型。
统计CCKAR基因+471C/G位点基因型检出个体数,计算群体遗传纯合度、遗传杂合
度、有效等位基因数和多态信息含量以及SatI酶切位点的基因型频率和基因频率,并进行
卡方(x2)检验。
结果与分析
900bp的片段。此片段电泳检测结果与预期一致。并对产物进行纯化回收准备用于下游实
验。
对CCKAR基因+471C/G位点扩增产物用限制性内切酶SatI酶切,再通过1.5%琼脂糖凝
胶电泳对酶切产物进行检测分型,发现CC、CG和GG三种基因型。
在实验所检测的9个猪品种中大围子猪CG基因型频率最高(0.6389),杜洛克猪CG基
因型频率最低(O。4574)。从等位基因分布频率来看,在5个地方品种中五指山猪等位基
种的遗传纯合度相差不大且均略高于0.5。其中杜洛克猪的遗传纯合度最高
(0.5354),大围子猪的遗传纯合度最低(O.5015):从有效等位基因数上看,所有品种
的有效等位基因数都比较高,其中大围子猪的有效等位基因数最高(1.9238),杜洛克猪的
有效等位基因数最低(1.8679);从多态信息含量上看,各个品种多态信息含量都处于
0.25至1J0.5之间。
讨论与结论
在基因型分布上,CG基因型分布占所有品种的比重为56%为优势基因型;所有品种
在该位点上的C、G等位基因频率相差不大。在地方猪种中,等位基因C为优势基因:在
外来品种和杂交品种中,等位基因G为优势基因。所有品种多态信息含量都处于0.25到
0.5之间1,说明在该位点上各品种具有较丰富的遗传多态性,且遗传变异较大。
致谢:本研究由国家863项目(2008AAl01008)资助。‘
作者简介:彭兴(1986一)男,硕士,px~bio@126.corn
木通讯作者hsq07@126.corn
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