基因调控网络模型构建方法.pdfVIP

第 二 军 医 大 学 学 报 ； （） ２００６Ｊｕｌ２７ ７ ·７３７ · 　　 　 ＡｃａｄＪ Ｓｅｃ Ｍｉｌ Ｍｅｄ Ｕｎｉｖ ·专题报道· 基因调控网络模型构建方法 １ １ １ ２ １ 虞慧婷 ，吴 骋 ，柳伟伟 ，付旭平 ，贺 佳  　 　 （ 第二军医大学卫生勤务学系卫生统计学教研室，上海 ； 复旦大学遗传学研究所遗传工程重点实验室，上海 １． ２００４３３ ２． ） ２００４３３ ［摘要］ 基因调控网络的研究从基因之间相互作用的角度揭示复杂的生命现象，是功能基因组学研究的重要内容，也是当前 　 生物信息学研究的前沿。基因芯片技术在生物信息学中的应用为基因调控网络的研究提供大量可供研究与分析的基础数据。 本文介绍了基因调控网络的起源与近年来的发展情况，详细说明了基因调控网络构建的前提与基本原理，并分析几种经典调 控网络模型：布尔网络模型、线性及非线性模型和贝叶斯网络模型，阐述各种模型构建的基本原理和算法，结合基因芯片的数 据特点，探讨各种模型的优缺点及其适用情况，对各种网络模型进行分析与总结。 ［关键词］ 基因调控网络；布尔网络模型；线性模型；非线性模型；贝叶斯模型 　 ［中图分类号］ ［文献标识码］ ［文章编号］ （ ） Ｑ７５６ Ａ ０２５８８７９Ｘ ２００６０７０７３７０４ 　 　　　 　 　　　 　 Ｍｏｄｅｌｉｎ ｏｆ ｅｎｅｒｅｕｌａｔｏｒ ｎｅｔｗｏｒｋｓ ｇ ｇ ｇ ｙ １ １ １ ２ １ ， ， ， ，  （ ， ＹＵ Ｈｕｉｔｉｎ ＷＵ Ｃｈｅｎ ＬＩＵ Ｗｅｉｗｅｉ ＦＵ Ｘｕ ｉｎ ＨＥＪｉａ １．ＤｅａｒｔｍｅｎｔｏｆＨｅａｌｔｈＳｔａｔｉｓｔｉｃｓ Ｆａｃｕｌｔ ｏｆＨｅａｌｔｈ ｇ ｇ ｐ ｇ ｐ ｙ ， ， ， ； ， Ｓｅｒｖｉｃｅｓ ＳｅｃｏｎｄＭｉｌｉｔａｒ ＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔ Ｓｈａｎ ｈａｉ２００４３３ Ｃｈｉｎａ ２．ＳｔａｔｅＫｅ Ｌａｂｏｒａｔｏｒ ｏｆＧｅｎｅｔｉｃＥｎ ｉｎｅｅｒｉｎ Ｉｎｓｔｉ ｙ ｙ ｇ ｙ ｙ ｇ ｇ ， ， ， ） ｔｕｔｅｏｆＧｅｎｅｔｉｃｓ ＳｃｈｏｏｌｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅ ＦｕｄａｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔ Ｓｈａｎ ｈａｉ２００４３３ ｙ ｇ ［ ］ （ ）， ， ＡＢＳＴＲＡＣＴ Ｇｅｎｅｒｅ ｕｌａｔｏｒ ｎｅｔｗｏｒｋｓ ＧＲＮ ｗｈｉｃｈｆｏｃｕｓｅｓｏｎｔｈｅｃｏｍ ｌｅｘｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓｏｆ ｅｎｅｓｉｎｌｉｆ