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深腾7000超级计算机性能说明.doc
深腾7000
深腾7000百万亿次超级计算系统,2008年由科技部863专项与中国科学院信息化专项共同支持建设,由联想公司与中国科学院计算机网络信息中心(以下简称为网络中心)联合研制,于2008年12月中旬开始在网络中心安装调试;2009年4月24日正式面向社会提供服务(深腾7000也是国内首台对外服务的百万亿次计算机)。截至2014年11月底,深腾7000共累计为院内外近500名用户提供计算机时逾3亿CPU小时,在国内首先支持、培育了一批千核至万核级应用,支持国家自然科学基金、863、973、科学院、北京市等项目近400个,取得较好的社会效益。2014年11月底,随着网络中心新一代 “元“超级计算系统安装完成并开始运行服务,已持续运转近6年的深腾7000关机停止服
以下是深腾7000各子系统参数(具体配置、数量见深腾7000配置清单)、耗电、空间占用、系统移机需自行配套解决的设备情况,及需要联想公司后续提供的技术服务:
整体性能
深腾7000混合结构的高性能计算集群主要指标如下:
系统全部采用64位高性能处理器。
整机共包括3208个Intel Xeon四核处理器,384个Intel Itanium2双核处理器,共13600个CPU核心。
用于计算的处理器核心共12320个,理论性能为142Tflops(所有节点的总性能为158Tflops)。
系统内存总量为66TB,其中计算部分内存总量约60TB。
系统内部采用4x DDR infiniband连接,点对点理论带宽2GB/s(实测MPI点对点带宽1.51GB),延迟<3μs(实测MPI点对点延迟1.5μs)。
系统的外部存储容量约1410TB,包括354TB的全光纤磁盘阵列、1PB容量的磁带库、64TB容量的虚拟带库。配备了数据迁移系统与数据备份软件,保障了数据的高效管理、使用与安全。
采用Linux操作系统、LSF HPC7.0作业管理系统。
高性能文件系统:Lustre、FS。
刀片节点
深腾7000共配有1288台IBM HS21SM刀片服务器,其中计算刀片节点1140个(采用无盘方案),IO节点120个,网络启动服务器12个,管理、登录等服务节点共16个。刀片节点的单机配置如下:
配置2个Intel XeonE5450四核处理器(3.0GHz,L1:32KB+32KB, L2:2x6MB,4条浮点流水线,单核心性能为12Gflops,单CPU性能为48Gflops。
内存32GB。
配备4x DDR infiniband 网卡(HCA)。
配备千兆以太网卡。
IO节点、启动节点等配备4Gbps光纤卡(HBA)。
所有刀片节点总性能为123.6Tflops,总内存41.2TB;其中计算刀片的总性能为109Tflops,总内存36.5TB。
厚节点
深腾7000系统中的厚节点采用IBM X3950M2服务器,共38台,总性能28Tflops,总内存19TB。其单机配置为:
NUMA结构,节点内采用IBM专用网络连接。
配置16个Intel Xeon 四核处理器(2.93GHz,L1:32KB+32KB,L2 9MB),共64个CPU核心。
内存512GB。
配备4x DDR infiniband 网卡(HCA),每节点4块。
配备千兆以太网卡。
胖节点
深腾7000的胖节点采用SGI Altix4700,使用Intel Itanium2处理器,总性能5Tflops,内存总量5TB,具体配置如下:
包括2个计算节点、1个头节点、2个文件服务节点。
胖节点(计算节点),节点采用NUMA结构,配置94个双路刀片模块,共188颗处理器,376个CPU核心,共享内存约2.5TB,主要用于批处理作业计算。
头节点,由1台胖节点通过逻辑分区实现,用于用户登录、编译与调试程序、提交作业。头节点配置4个双路刀片,共16个CPU核心,64GB内存
文件服务节点,由1台SGI Altix450通过逻辑分区功能成为2台CXFS文件系统器使用,用户不可直接访问。
共384颗Intel Itanium2双核处理器。型号9140M, 1.66GHz主频,666MHz总线。L1 Cache: 16KB(Data)+16KB(指令),L2 Cache: 256KB(Data)+1MB(指令),L3 Cache: 18MB。
系统浮点峰值5Tflops。
内存总量5TB。
互连网络。
节点内采用NUMALink互连(双向带宽6.4GB/s,延迟1us)。
节点间采用千兆以太网互连,用于管理、NFS文件系统。
节点间采用2条20Gbps的Infiniband互连。
可视化节点
深腾7000共配有12台可视化节点,配有高性能图形显示卡与商业可视化软件,用于用户计算结果的可视化处理。其单机配置如下:
采用3U
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