基于耦合双向聚类技术的DLBCL异质性分析.pdf

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2015-09-06 发布于湖北
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遗传HEREDITAS (Beijing) 28(9): 1129~1134, 2006 技术与方法基于耦合双向聚类技术的DLBCL 异质性分析 1, 2 2~5 1 2, 3 3 3 3, 6 , , , , , , 同济大学医学遗传研究所上海同济大学生命科学技术学院上海哈尔滨医科大学生物信息学系哈尔滨 (1. , 200092; 2. , 200092; 3. , 150086; 哈尔滨工业大学计算机学院哈尔滨首都医科大学生物医学工程学院北京 4. , 150001; 5. , 100054; 6. Departments of Cardiovascular Medicine and Molecular Cardiology, Cleveland Clinic Foundation, Cleveland, Ohio 44195, USA) 摘要: 基因芯片技术为疾病异质性研究提供了有力的工具当前基于传统聚类分析的方法一般利用芯片上大量基 , 因作为特征来发现疾病的亚型因此它们没有考虑到特征中包含的大量无关基因会掩盖有意义的疾病样本的分割 , (Heterogeneous Analysis Based on Coupled Two-Way 为了避免这个缺点提出了基于耦合双向聚类的异质性分析方法 Clustering, HCTWC)来有哪些信誉好的足球投注网站有意义的基因簇以便发现样本的内在分割 B 该方法被应用于弥漫性大细胞淋巴瘤 (diffuse large B-cell lymphoma DLBCL) , DLBCL 芯片数据集通过识别的基因簇作为特征对样本聚类发现生存期分别为55%和25% 的两类DLBCL 亚型(P0.05), 因此, HCTWC 方法在解决疾病异质性是有效的关键词 ; ; ; : 基因表达谱疾病异质性超顺磁性聚类概念一致性中图分类号: R394