棉花油分合成相关基因的SSCP标记开发.pdf

分子植物育种，2011 年，第9 卷，第3 期，第336-342 页 Molecular Plant Breeding, 2011, Vol.9, No.3, 336-342 研究报告 A Letter 棉花油分合成相关基因的SSCP 标记开发 1,3 1 1 1 1 1 1 1 2 1* 谢晓兵 于霁雯 吴嫚 郑云娜 翟红红 李兴丽 范术丽 宋美珍 张金发 喻树迅 1 中国农业科学院棉花研究所, 安阳, 455000; 2 新墨西哥州立大学作物与环境科学院, 拉斯克鲁塞斯, 88003; 3 西北农林科技大学农学院, 杨凌, 712100 * 通讯作者, yu@ 摘 要 本研究根据棉花油份合成相关基因(lysophosphatidic acid acyltransferase, LPAAT; diacylglycerol acyltransferase, DGAT; phosphoenolpyruvate carboxylase, PEPC) 设计了75 对引物，在8 个棉花品种中运用 SSCP 技术对其进行多态性检测。结果表明，在75 对引物中，经PCR 扩增，有55 对引物在 1.5%的琼脂糖凝 胶电泳上出现清晰的条带。55 对引物又经SSCP 分析，21 对引物在四个陆地棉之间产生47 个多态性位点； 16 对引物在4 个海岛棉间产生30 个多态性位点；39 对引物在这8 个棉花品种间共产生104 个多态性位点， 13 对引物在4 个陆地棉之间和四个海岛棉之间同时出现多态性。由上可知，运用SSCP 技术分析棉花油份 合成相关基因得到的多态性位点较多。进一步经聚类分析后可知，3 个陆地棉( 中12, SG747, 苏远7252) ，3 个 海岛棉(海7124, Giza75, 海岛棉3-79)分别聚在了一起。 关键词 棉花, SSCP 标记, 聚类分析 Development of SSCP Markers for Genes Related to Oil Synthesis in Cotton Xie Xiaobing 1,3 Yu Jiwen 1 Wu Man 1 Zheng Yunna 1 Zhai Honghong 1 Li Xingli 1 Fan Shuli 1 Song Meizhen 1 Zhang Jinfa 2 Yu Shuxun 1* 1 Cotton Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Anyang, 455000; 2 Department of Plant and Environmental Sciences, New Mexico State University, Las Cruces, 88003; 3 College of Agronomy, Northwest A F University, Yangling, 712100 *Corresponding author, yu@ DOI: 10.3969/mpb.009.000336 Abstract Genetic variation exists in cotton seed oil content, and genes and gene expression related to oil content and lipid synthesis are poorly understood. In this study, a total of 75 primer pairs were designed for oil synthesis-related genes that encode lysophosphatidic acid acyltransferase (LPAAT), acyl-coa: diacylglycerol acyltransferase (DGAT) and phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC). Eight genotypes were selected from the cultivated tetraploid cotton including four G. hirsutum genotypes and four G. barbadense genoty