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园 艺 学 报 2011 ，38 （6 ）：1081 –1088 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 番木瓜果实成熟相关基因的 cDNA-AFLP 分析 及克隆 * 申艳红，陈晓静，卢秉国，何玮毅 （福建农林大学园艺学院，园艺植物遗传育种研究所，福州 350002 ） 摘 要：为了探讨番木瓜果实成熟机理，利用 cDNA-AFLP 技术对破色期和半黄期的番木瓜果实进行 基因差异表达分析，获得了 50 个与果实成熟相关的差异基因片段，其中 28 个与 GenBank 数据库中的功 能基因同源，分别参与了果实成熟过程中基因表达调控，DNA 与蛋白质合成及运输，蛋白质降解，能量 代谢，营养物质代谢和逆境胁迫反应等过程。在差异片段序列基础上设计特异引物，采用 cDNA 末端快 速扩增（RACE ）技术成功克隆了 4 条差异基因 cDNA 全长，分别命名为 CpGMP、CpPAA1、CpPOD 和 CpMYB。半定量RT-PCR 分析结果表明，随着果实的成熟衰老，4 个基因的表达量相应变化，说明其可能 参与果实的成熟过程。 关键词：番木瓜；果实；成熟；cDNA-AFLP ；差异表达；RACE 中图分类号：S 667.9；Q 78 文献标识码：A 文章编号：0513-353X （2011 ）06-1081-08 cDNA-AFLP Analysis and Cloning of Fruit Ripening-related Genes from Papaya * SHEN Yan-hong，CHEN Xiao-jing ，LU Bing-guo ，and HE Wei-yi （College of Horticulture，Institute of Genetics Breeding in Horticultural Plants ，Fujian Agriculture and Forestry University，Fuzhou 350002，China ） Abstract ：In order to explore molecular mechanism of fruit ripening and the key softening-related genes，cDNA-AFLP technique was used to identify differentially expressed genes during papaya fruit ripening. Fifty transcript-derived fragments （TDFs ）were obtained from the analysis of semi-yellow and color-break stage of papaya fruit. Bioinformatics analysis showed that 28 TDFs were homologous to the known functional genes ，which could be divided into different functional groups including gene expression regulation ，DNA and protein synthesis and transport ，protein degradation ，energy metabolism，nutrient metabolism and stress responding. Using specific primers designed fr