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5-氟尿嘧啶…NO分子复合物的结构与性质.pdf
第27卷第3期 计算机与应用化学 V01.27,No.3
and March.2010
2010年3月28日 ComputersAppliedChemistry
5-氟尿嘧啶…NO分子复合物的结构与性质
李大枝1,张士国h,卞贺2
(1.滨州学院化学与化工系,滨州市材料化学重点实验室,山东,滨州,256603;
2.中国石油大学(华东)化学化工学院,山东,东营,257061)
式是NO的N、O原子与5一氟尿嘧啶的N—H键形成氢键,或O原子与5一氟尿嘧啶分子间通过弱耵键结合在一起。最
稳定复合物的结合能为一7.86kJ/mol。N原子与5一氟尿嘧啶的结合更有优势,N结合的复合物中,NO键长缩短,伸
缩振动频率蓝移,而O结合的复合物中,NO键长伸长,伸缩振动频率发生红移。
关键词:密度泛函理论;弱作用复合物;5-氟尿嘧啶;NO
中图分类号:O641;TQ015.9;06-39文献标识码:A
1 引言 2计算方法
NO这一生物小分子,在生命过程中扮演着极为重要的
角色,因其重要的生物功能而被称为生物信使分子¨。2]。研 分子形成复合物,既可以提供合理的几何参数和准确的结合
究表明,NO作为生物体内1种简单的自由基,参与多项生理 能等信息,计算速度又快。因此,使用包括电子相关能的
活动,且对肿瘤的生长有重要的影响,近年来,人们在研究中
发现NO除了自身的抗肿瘤作用以外,还可以加强肿瘤细胞 型和局部极小构型,广泛有哪些信誉好的足球投注网站NO及与5一Fu相互作用的可能
(包括乳腺癌、黑色素瘤等)对5.氟尿嘧啶(5-Fu)等一些化
疗药物的敏感性,NO还是5.Fu促使肿瘤细胞凋亡的效应分
子。由于NO分子与生物分子的结合不够稳定,实验结果往 初始构型,在振动分析以确认是能量极小点而不是鞍点的基
往不如人意。因此,用量子化学法研究NO与5一Fu形成的复础上,计算单点能。同时,使用自然键轨道(NBO)法和分子
合物,对于了解其作用规律,阐明其生物学效应机制,无疑是
有益的。
近年来,分子间的弱作用已经引起了研究工作者的广 合物的结合能。复合物的结合能定义为复合物能量与单体
o 能量之和的差:
泛关注日。1…,NO作为生物“明星”分子备受重视。Ball等M
利用从头算法G2研究NO与H:0分子的作用,Magdalena
等o“钊用红外实验和从头算相结合的方法,分析HONO与式中E是用不同方法计算复合物的单点能量,所有计算采用
Gaussian03程序‘…。
NO的作用,Krim和Alikhani¨0。用红外技术结合密度泛函理
论(DFT)计算法研究NO…HCl化合物,本文¨u用密度泛函
3 结果与讨论
理论计算胞嘧啶…NO复合物,许多研究者运用DFT研究化
学和生物化学问题,内容涉及无机、有机小分子及其复合物, 在广泛考虑NO与5-Fu各种可能结合方式的基础上,将
对无机、有机小分子间的氢键等相互作用,DFT计算结果也
能合理地解释¨4。J。鉴于此,本文使用DFT的B3LYP方法
++G(d,P)水平上全优化并做振动分析,优化结果找出5
研究5-Fu…NO复合物的结构与性质,获得结合方式、几何个能量极小的构型(均为能量极小点,无虚频),构型分为2
结构、稳定性、振动光谱等详细信息,以期对了解NO与5.Fu
的作用规律,阐明其生物学效应机制有一定的指导作用。 氢键,其中2个构型由N—H键与氮原子之间发生作用[图1,
收稿日期:2009-04-28;修回日期:2009-07-06
基金项目:山东省教育厅科研发展计划项目(J06D51);山东省自然科学基金项目(Y2007826)
作者简介:李大枝(1971一),女,博士,
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