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92份棉花资源遗传多样性的SSR分析
西北植 物学报 ,2010,30(8):1557—1564
ActaBot.Borea1.-Occident.Sin.
文章编 号:1000—4025(2010)08—1557—08
92份棉花资源遗传多样性的SSR分析
贺道华,邢宏宜 ,李婷婷 ,汤 益,曾 舟
(西北农林科技大学 农学 院,陕西杨 陵 712lOO)
摘 要 :选用均匀分布于棉花全基 因组 的 132个 SSR标记 ,对精选 的 92个棉花品种 (系)进行分析 ,结果表 明,共扩
增 出494个多态性条带,每个引物平均 3.69个 。等位基 因变异的多态性信息含量 (PIC)在 0.0100~0.8714之
间,平均为 0.5466。采用 NTSYS-pc软件计算 品种对 间的相似系数 ,92个 品种之 间的成对相似系数平均 为
0.7292±0.1350,变幅在 0.4118~O.9575之间,其 中陆地棉种 内48.94 的品种对相似系数≤0.8000,海岛棉
种 内5O.91 的品种对相似系数≤0.8000,表 明此 自然群体的遗传基础较为宽泛 。根据 Jaccard’S相似系数所得 的
UPGMA聚类 图和系谱追溯 的结果显示 ,此群体 中品种 的选育过程复杂 ,血统来源多样 ,存在较高程度 的遗传多样
性 。
关键词 :棉花 ;种质资源 ;自然群体 ;SSR;遗传多样性
中图分类号:Q346 .5 文献标识码 :A
GeneticDiversityof92Cotton AccessionsEvaluatedwithSSR M arkers
HE Dao—hua,XING Hong—yi ,LITing—ting,TANG Yi,ZENG Zhou
(CollegeofAgronomy,NorthwestAFUniversity,Yangling,Shaanxi712100.China)
Abstract:A setof132SSR markers,spanning thewholegenomewithan averageof5SSRsperchromo—
some,wereselectedtogenotypethenaturalpopulationconsistingof92accessions.Fourhundredandnine—
ty—fourpolymorphicbandswereobtainedwiththeaverageof3.69polymorphicbandsperSSR marker.The
polymorphism information content (PIC)foramarkerlocusis0.010 0~ 0.8714 with theaverageof
0.5466.Jaccard’SgeneticsimilaritycoefficientswerecalculatedusingthesoftwareofNTSYS—pcversion
1.80.Meanpairwisegeneticsimilaritycoefficientsof92cultivars (1ines)was0.7292±0.1350,withthe
rangeof0.4118to0.9575.Thepercentageofpairwisesimilaritycoefficientlessthan0.800,is48.94
and5O.91 fortheuplandaccessionsandsea—islandaccessions,respectively.Thisindicatedthatthegenet—
iCbasisofnaturalpopulationwasbroadtoacertainextent.TheUPGMA dendrogram basedonJaccard’S
similaritycoefficientsandtheinformation ofgenealogyofaccessionsindicatedthat:theseaccessionswere
developedthroughacomplexbreedingprocessand theancestrywasmulti—descentorigins,which resulted
thata
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