《2分钟学会UVP的凝胶电泳分析软件》.doc

2分钟学会UVP的凝胶电泳分析软件 在各个论坛上看以过许多凝胶电泳分析的软件，但没有UVP使用的Labwork的介绍。 8`_ckIgr ?如果你购买了UVP的凝胶电泳拍摄及分析系统，上面就会带一个labwork分析软件。打开这个软件你就可以发现其界面非常熟悉，原来这就是Media Cybernetics公司利用Imageproplus程序的内核专门应用于分析凝胶电泳图片的软件。上面还有许多Imageproplus的功能呢。 Z!jZF~4p ?Ks9U^bPs ?Ge|caiH1I ?ejD
;lvf ?分析电泳图片还是很简单的，两分钟就能学会，只要在那个1D-Gel工具条从上往下一个一个点开来设置一下就OK。 A+NLo[swwu ?打开一个图片后，先要把图片上的电泳条带摆得横平竖直，加样孔处于图片上方。这一步只要点第一个菜单rotate，然后用鼠标转图片就是。 ; #e-pkV ?) Q]kUG#` ?第二步是指定泳道。点Lanes.利用弹出的菜单可以删掉或添加泳道，用鼠标可以拖动泳道位置，还可以在泳道上下边拖来延长或缩短泳道长度。 qvhTc6oH ?泳道宽度设置时，先勾上Uniform lanes width,然后在最上面的lanes width上把数值加大或减小一些。让选择泳道宽度框全部覆盖住条带。 F(}d|z@@ ?aXCT@B ?9akCvY#Q ?设置完了泳道，再设置条带。 %\%1EZQ% ?占bands菜单，在dark bands bright background与bright band dard background之间选一个，(DNA凝胶是白带黑背景，蛋白质凝胶是黑带白背景)min band height设一个稍大的值，(别太小，否则自动找到一大堆条带还得一个个删。) |h!#Q{7l ?点一下find band。就自动找到一些明显的条带了，用add 和delete band按纽加上未找到的条带，删掉误识别的条带。这个操作也很简单，点add band按纽，出来一个新对话框，不理它，可以在电泳照片上认为该有条带的地方点一下，就强迫加上了一个条带。还可以在lane frofile窗口的曲线上准确找到峰顶位置点一下加上条带。加完后点OK回到band窗口。 b{
(!Ls_ ?注意每个条带也有一个计算范围，可在曲线上拖它的上下边界。这个边界的选择要仔细。一方面尽量让各条带的范围一致，另一方面则是选择条带光密度峰的山脚处作为边界。这两者很难同时满足。经常得牺牲一方面。 N@Bqe{r6j ?2lE { P ?l?Bv9k.^? ?设置完泳道与条带，下一条是设置背景。前面还有个加样孔位置要设置，因为我们已经把加样孔放到上方了，就不必设置它了。 ;{j:5+ ?背景的较正方法有许多选择，但只有一个实用。就是joining valleys.上一帖图中峰下面有一根斜线，那就是背景扣除的界限。下面的面积被扣除。只计算背景线上方的区域作为条带定量的依据。 DM~Q+C=Yr ?^V_vpr]}P ?最麻烦的是设置marker参数。 YdhrFw0`~r ?点marker菜单，弹出设置窗口，上面是指定marker泳道位置的按纽。系统默认第一泳道为marker。但我们经常把marker放到另的泳道上去。这块胶上有两个marker，分别在第一与第十三泳道上，设定方法是: sW@4r/F:D ?点reset清除掉窗口，再点select/unsel...按纽。在第一与第十二泳道上分别点一下，窗口中会出现lane 1和lane 13字样，说明这两个泳道被指定为marker. F#O. i, ?X 4;+` ?D@7\Fg ?下一步要指定Marker中各条带的分子量。 xa5I{U ?1.点new按纽，出来一个新的窗口，最上面要起个名字(test)。 [ ;h@ q} ?2.在下面的数字窗口中输入第一个分子量数字(2000)。点一下旁边的勾。 ?2[]h:wp ?3.再点add按纽。 !H~G_?Mf\O ?4.可见第一个分子量数据已经显示到窗口里了。 `?2S4lN/ ?5.重复2、3输入全部的分子量数值。 p@YU7_sF^! ?6.点OK回到上一个窗口，可以看见marker的分子量已经输入。 WSWaq\9]8 ?+ptO\mo ?[;83 IoU} ?还没完呢。 !n@Yg2w ?点一下auto loc按纽，这里要注意，如果是六个marker条带，则marker泳道里一定得有正好不多不少六个选定的条带。否则就乱套了。 yI)~-
E. ?有时候电