狼肠道菌群生态的犬科线粒体基因组比较和系统发育.pdf

0225 Code：1 University Code：B10009 Register Dissertationforthe ofDoctor Degree BACTERIALDIVERSITYINTHE TRACTOFWOLVESAND ANDPHYLOGENETICANALYSIS0F CANIDAEMITOCHONDRJALGENOMES Candidate： ChenLei Honghai Supervisor： Prof．Zhang Associate Prof．Ma Supervisor： Jianzhang Academic for：Doctor DegreeApplied WildlifeProtectionandUtilization Speciality： Dateof0ralExamination：June，2010 Northeast University： ForestryUniversity 摘要 作为现存食肉目动物中分布最为广泛的类群，犬科动物与人类生活有着千丝万缕的 联系。在对犬科动物的研究过程中，消化生理学领域的研究具有举足轻重的地位，其中 有关消化道菌群生态的研究近年成为学术界的热点话题。尽管目前对家犬肠道菌群的研 究已经比较深入，但是狼的消化道菌群目前仍是个未知数。为了解狼的肠道菌群组成和 多样性特征，本文第一部分通过构建菌群16SrRNA基因文库和进行系统发育分析，对 采集自中国内蒙古自治区达赉湖自然保护区附近的3只健康成年狼的粪便菌群结构进行 了分析。我们将3只狼的粪便样品分别构建16SrRNA基因文库，从中随机挑取550个 克隆进行检测，共得到307个不同的非嵌合体的细菌16SrRNA基因序列。根据97％的 着98个克隆的16S II数据 库中现有序列的相似度小于98％，为未分类、未鉴定的细菌。系统发育分析表明，狼粪 total OTUs)，Bacteroidetes(1 其余四个科依次是： Ruminococcaceae， 门和Fusobacteriales门的细菌组成和数量上存在较大差别。 线粒体基因组是比较基因组学研究的理想工具。家犬(Canis lupusramiliaris)的线 粒体全基因组测序于1997年完成，至今已测序的犬科动物有四种：家犬、狼(白，z西 lupus)、郊狼(Canislatrans)和赤狐(VulpesVulpes)。本课题组于2008年对分布于青 海省的西藏狼(Canis lupuslaniger)的线粒体基因组进行了测序。然而，中国分布的其