马鞭草科和茜草科植物DNA条形码及研究.pdf

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2015-11-29 发布于安徽
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II I II IIII III I iii㈨IIilllliiiiiU 00802 Y21 目录摘要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．…．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．I ABSTRACT．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．…．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．III 前言…………………………………………………………………………………………………．1 第一部分马鞭草科植物DNA条形码序列筛选………………………………．5 1 实验材料…………………………………………………………………5 1．1马鞭草科植物材料………………………………………………．．5 1．2主要仪器及试剂……………………………………………………5 1．3溶液配制……………………………………………………………6 2实验方法………………………………………………………………。6 2．1样品总DNA的提取、PCR扩增和测序………………………6 2．1．1马鞭草科植物总DNA的提取…………………………………6 2．1．2马鞭草科植物DNA的扩增……………………………………8 2．1．2．1引物序列…………………………………………………………8 2．1．2．2反应体系………………………………………………………8 2．1．2．3反应程序………………………………………………………9 2．1．3测序…………………………………………………………………………………．9 2．2数据处理方法……………………………………………………。12 3 结果…………………………………………………………………………………………13 3．1各个候选序列PCR扩增和测序成功率、长度、GC含量……13 3．2不同候选DNA条形码序列的种内、种间差异………………．13 3．3不同DNA条形码候选序列的barcodinggap检验……………16 3．4马鞭草科和大青族样本DNA条形码候选序列的鉴定效率评价．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．…．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．…．…．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．1 8 3．5马鞭草科大青族遗传距离及种间变异………………………．．20 3．5．1遗传距离值………………………………………………………20 3．5．2种间变异………………………………………………………。20 3．6马鞭草科NJ树和UPGMA树的聚类分析……………………．．22 4．i寸论…………………………………………………………………………………………25 4．1候选条码的选择……………………………………………………25 4．2聚类分析…………………………………………………………．26 第二部分茜草科植物DNA条形码序列筛选……………………………．28 l 实验材料………………………………………………………………．28 1．1茜草科植物材料……………………………………………………28 1．2主要仪器及试剂…………………………………………………28 2 实验方法………………………………………………………………．29 2．1样品总DNA的提取、PCR扩增和测序……………………．．29 2．1．1茜草科植物总DNA的提取