什么是遗传图谱与物理图谱.docVIP

什么是遗传图谱和物理图谱？两者的异同是什么？遗传图谱在基因组研究中的意义何在？ 答：遗传图谱：某一物种的染色体图谱（也就是我们所知的连锁图谱），显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置，而不是在每条染色体上特殊的物理位置。DNA结构。 减数分裂重组的频率并不统一沿大多数染色体。有一些热点和冷点在重组和/或突变。热点和冷点会导致相当大的格律失真时，遗传图谱和物理地图并排排列时。 遗传图谱表示的是基因或标记间的相对距离，以重组值表示，单位CM 物理图谱表示的是基因或标记间的物理距离，距离的单位为长度单位，如μm或者碱基对数（bp或kp）等。 意义：通过遗传图谱，我们可以大致了解各个基因或DNA片断之间的相对距离与方向，如哪个基因更靠近着丝粒，那个更靠近端粒等。遗传图谱不仅是现阶段定位基因的重要手段，即使在人类基因组全物理图谱建立起来之后，它依然是研究人类基因组遗传与变异的重要手段。 基因组和转录组有什么对应关系？两者的差异何在？ 答： 对应关系：基因组是指一种微生物（包括细菌和病毒）或其它生物体细胞中的总 DNA或RNA(是指逆转录病毒),包括核DNA，细胞器DNA(动植物线粒体DNA和植物叶绿体DNA)和染色体外遗传成分(如细菌的质粒DNA)。?转录组即一个活细胞所能转录出来的所有mRNA。研究转录组的一个重要方法就是利用DNA芯片技术检测有机体基因组中基因的表达。从基因组DNA转录的基因总和，即转录组，也称味表达谱，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。??mRNA(转录组)是基因表达的中间体，功能性蛋白质(蛋白质组)是基因功能的执行体。 差异： 基因组是一个十分稳定的体系，同一种系不同个体之间的染色体数目是相同的，各染色体上有相同数量的基因和基因分布，也有基本相同的核苷酸顺序，即基因组是一个相对静态的概念，一个有机体从它的发生、发展到衰老、死亡，不同细胞、组织和器官的基因组是基本稳定不变的。和基因组水平不同，转录组是高度动态的，当细胞受到侵犯时，甚至当细胞处于正常的生理活动如复制，分裂时，基因的转录情况也会变化很大。mRNA是信使RNA，携带着从基因组转录下来的遗传信息，并非所有基因组序列都能转录。原核生物中非转录成分较少，基因组序列利用效率较高真核生物染色体存在大量非转录成分mRNA稳定性较差，转录的RNA原始产物要经过切割、修剪、添加、修饰和异构化形成成熟mRNA其中内含子在mRNA拼接时被切除掉通过选择性拼接，一个基因可以编码多条多肽链。正常的mRNA拼接发生mRNA内部，而在一些低等生物中还存在着奇怪的反转录 (trans-splicng)现象，拼接发生在两条mRNA之间，即两条mRNA在剪接因子作用下，第一条剪接下来的外显子与另外一条剪接下来的外显子拼接在一起，编码一个新的多肽。转录组只研究mRNADNA，构建质粒文库，然后对质粒两端进行随机测序。 多细胞动物：鸟枪法（例如果蝇）把基因组直接打碎成3kb左右的小片段，做成质粒文库，测序并拼接。研究者将果蝇的基因组随机地切成小片,然后测定每一个DNA小片段的核苷酸序列,他们称这些小片段是“测序工厂”。测定这些小片段仅化了4个月时间。他们用计算机来检测重叠序列,从而测定片段之间的顺序。最后,将这些小片段再拼接在一起,装配起整个基因组。在拼接之前,须在DNA全长中避开重复序列,才能稳保成功。 大型动物：采用图位法和鸟枪法，大型动物的基因组很大，所以对其测序先采用基因组序列测定的传统方法----基于BAC的方法，得到BAC文库后，选择其中一些进行鸟枪法测序，首先：有一个根据目的基因的有无建立起来的遗传分离群体，如F2、DH、BC、RI等。二是开展以下几项工作： 　　1)首先找到与目标基因紧密连锁的分子标记； 　　2)用遗传作图和物理作图将目标基因定位在染色体的特定位置； 　　3)构建含有大插入片段的基因组文库(BAC或YAC库)； 　　4)以与目标基因连锁的分子标记为探针筛选基因组文库； 　　5)用获得阳性克隆构建目的基因区域的跨叠群； 　　6)通过染色体步行、登陆或跳跃获得台有目标基因的大片段克隆； 　　7)通过亚克隆获得带有目的基因的小片段克隆； 　　 8))用鸟枪法法对P1, YAC Clone进行测序。 10)用计算机进行序列结合、编辑 有一大型海洋经济动物，对其遗传背景了解极少，你认为对其基因组学研究应该如何制定研究计划。 答：应该对其结构基因组和功能基因组进行研究 一、结构基因组的研究包括构建四张图谱：遗传图谱、物理图谱、序列图谱、基因图谱 ① 遗传图谱：它是以具有遗传多态性的遗传标记为“路标”，以遗传学距离为图距的基因组图。遗传图谱的绘制需要应用多态性标志是指有关构成基因组的全部基因的排列和间距的信息，它是通过对构成基因组的DNA分子进行测定而绘制的。相对位置部分