人易感H6N1禽流感病毒血凝素蛋白的B细胞抗原表位预测及进化分析.pdf

14 ChinJCel1Me1Immuno1)2015，31(1 · 论著 · 文章编号 ：1007—8738(2015)O1—0014—04 人易感H6N1禽流感病毒血凝素蛋白的B细胞抗原表位预测及进化分析 杨建课 ，袁 健 ，高继光 ，朱晓蕾 ，林爱琴 (皖南医学院医学生物学教研室，安徽 芜湖241002；安徽师范大学生命科学学院，安徽 芜湖241ooo) [摘 要] 目的 预测人易感 H6NI禽流感病毒血凝素蛋 白的B细胞抗原表位 ，并分析其进化特征。方法 从 GISAID和 GenBank两大数据库获得人易感 H6N1病毒的血凝素蛋白及近缘序列，采用多款预测软件分别预测了其B细胞线性和构象型抗 原表位，并分析了这些表位的保守性、适应性和进化特征。结果 综合各种因素共预测出4个线性表位 (表位A、B、c和D)和 2个构象型表位 (表位E和F)。表位c和位点41、157、186、187在进化过程中易发生突变，其余表位较为保守，其中表位D最 保守；位点 157受到强烈的正选择作用，它可能是 H6N1病毒逃避宿主免疫系统攻击的一个关键位点。结论 人易感 H6N1禽 流感病毒血凝素蛋白拥有5个保守的B细胞抗原表位 (3个线性、2个构象型)和 1个正选择作用位点，将为其疫苗的研制、致 病机制的理解和病毒防治提供理论基础。 [关键词]人易感H6N1禽流感病毒；血凝素蛋白；抗原表位；生物信息学；进化 [中图分类号]$858，R392—33，R857．3 【文献标志码]A Prediction and evolution ofB cellepitopesofhemagglutinin inhuman-infecting II6N1avian influenzavirus YANG Jianke ，YUANJian ，GAOJiguang ，ZHUXiaolei，LINAiqin DepartmentofMedicalBiology，WannanMedical College，Wuhu42 1002； CollegeofLifeSciences，AnhuiNormal University，Wuhu 241000 ，China [Abstractj 0bjectiveTopredictBcellepitopesofhemagglutinin(HA)ofhuman-infectingH6N1avianinfluenzavirusand analyzetheirevolutionarycharacteristics．Methods ThedatasetwasdownloadedfrOm GISAIDandGenBankdatabases．And thelinearandconformationalBcellepitopesofHA werepredictedseparatelybyvariousbioinformaticsoftware．Furthermore， theconservation，adaptationandotherevolutionary characteristicswerealsoanalyzedbysomebioinformaticmeans．Results Fourlinearepitopes(A，B，CandD)andtwoconformationalepitopes(EandF)wereobtainedafterconsiderationofmultiple factors．AndtheCepitopeandsites(41，157，186，187)mutatedeasily，buttheotherepitopeswereveryconservativeand theD epitopewasthemostconservative．Interestingly，thesite157wasidentifiedunderpositiveselection，suggestingthatit maybeaparticularlyimportantsitetomakethevirusevadethea~ackfrOm thehostimmunesystem．Conclusion TheHAof human—infectingH6N1avianinfluenzavirushasfiveconservativeBce