人骨髓间质干细胞诱导成骨分化蛋白质的鉴定及生物信息学分析.pdf

重庆医科大学学报 2015年第 40卷第 2期 (JournalofChongqingMedicalUniversity2015．VO1．40No．2) 一 275 一 DOI：10．13406／j．cnki．cyxb。000329 人骨髓问质干细胞诱导成骨分化蛋白质的鉴定及 生物信息学分析 张爱霞 ，余伟华z，王 涛 ，马保锋 。，徐彩霞。 (1．嘉应学院生命科学学院生物工程系，梅州 514015；2．中山大学中山医学院干细胞与组织工程中心，广州 510080； 3．中山大学附属第一医院转化医学中心实验室，广州 510080) 摘【 要】目的：通过蛋白质组学和生物信息学技术建立人骨髓间质干细胞 humanbonemarrowmesenchymalstemcells，hMSCs) 诱导成骨分化蛋白表达谱，为进一步阐明hMSCs的成骨分化机制提供基础资料。方法：收集 hMSCs诱导成骨分化的全蛋白，应 用双向凝胶电泳(two—dimensionalgelelectrophoresis，2-DE)技术和图像分析软件进行蛋白质点的识别和检测。选择清晰表达的 蛋白质点，应用基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱 (matrix—assistedlaserdesorptionionization—timeofflightmassspectromety． MALDI—TOF—MS)和生物信息学方法进行蛋白质的鉴定和分析。结果：通过 MALDI—TOF—MS和生物信息学鉴定了77种蛋白 质 ；建立了hMSCs诱导成骨分化蛋白质表达谱；利用GeneOntology对这些蛋白按分子功能和生物学途径进行了归类。结论 ：成 功建立了hMSCs诱导成骨分化蛋白质表达谱 ；为进一步阐明hMSCs成骨分化的分子机制提供了基础资料，为进一步构建 hM— SCs诱导成骨分化蛋白质表达数据库奠定了坚实的基础。 【关键词】骨髓间质干细胞；蛋白质组学；成骨分化；质谱鉴定；生物信息学 【中图分类号]R329．2 文【献标志码】A 【收稿日期】2014—02—03 Proteinidentificationandbioinformaticsanalysisofosteoblastdifferentiation frOm hUmanbonemarrOw mesenchymaIstem cells ZhnagAixia1，YuWeihua2，WangTao1,MaBaofe ，XuCaixia3 (1．DepartmentofBiologicalEngineering，CollegeofLifeSciences，JiaYingUniversity；2．CenterforStemCell nadTissueEngineering， 0n SchoolofMedicine，SunYat-senUniversity；3．LaboratoryofReserachCenter rTranslationalMedicine，theFirstAffiliatedHospital，SunYat-senUniversity) A【bstract]Objective：Toestablishproteinexpressingprofileofhumanbonemanowmesenchymalstemcells(hMSCs)whichwereinduced intoosteoblaststhroughproteomicandbioinformatictechniquesandtofurtherelucidatetheprecisemolecularmechanism ofhMSCs osteoblastdifferentiation．Methods：Thetotalproteinextractswereobtainedwithcelllysisbufferfrom hMSCswhichwereinducedinto osteoblasts．Two-dimensionalgelelectrophoresis(2-DE)an