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苦瓜的研究概况及种质资源研究设想
苦瓜的研究概况及种质资源研究设想 胡开林 华南农业大学 报告内容 一、苦瓜的研究概况 二、苦瓜种质资源的研究现状 三、苦瓜种质资源研究的设想 一、苦瓜的研究概况 苦瓜(Momordica charantia L.) 属于葫芦科(Cucurbitaceae)苦瓜属 (Momordica)的一年生植物, 种质资源主要分布在非洲和亚洲的热带地区。 苦瓜研究的主要区域 苦瓜研究的主要国家或地区 苦瓜研究的主要领域 苦瓜农学研究的主要领域 (1)种质的调查、收集与评价(Joseph et al,2008, Genetic Resources and Crop Evolution;Join et al,2009, Genetic Resources and Crop Evolution ) (2)利用分子标记进行遗传多样性分析( Dhillon et al,2007, Genetic Resources and Crop Evolution; Bharathi et al,2012, Genetic Resources and Crop Evolution ) (3)遗传图谱构建及农艺性状QTL定位(Wang et al,2013,Euphytica) (4)雌性系及其基因( Dey et al,2010, Euphytica; Behera et al, 2009, Scientia Horticulturae; Matsumura et al, 2014, Plos One; Ram et al, 2006, Journal of Heredity ) (5)乙烯及赤霉素对苦瓜性别分化的影响( Thomas et al,2008, Euphytica ) (6)白粉病(Park et al,2011,Plant Pathology Journal )、枯萎病( Cumagun et al,2010,Plant Protection Science;Relevante et al,2013,Archives of Phytopathology and Plant Protection ) 二、苦瓜种质资源的研究现状 1.葫芦科的生态地理进化历史 Schaefer等(2009)对葫芦科114个属进行生态地理与系统发育分析,认为葫芦科是单源的,起源于晚白垩纪的亚洲(约70My前)。 a. 晚白垩纪(约70My前) 1.葫芦科(Cucurbitaceae)起源于亚洲 b.古新世/始新世(约60-40My前)2.Zanonieae的祖先到达非洲;Xerosicyos的祖先到达马达加斯加; 3.Fevilleae的祖先到达南美 。 c. 渐新世(约30My前) 4.Siolmatra穿过大西洋进入南美 ;5.Momordica cochinchinensis(木鳖子)和Zanonia indica分别从非洲到达东南亚; 6. Ampelosicyos的祖先到达马达加斯加岛 d. 中中新世(约10My前) 7. Luffa从非洲传到美洲; 8. Cayaponia africana的祖先从南美传到西非; 9. 一些Sicyos的种从南美传到夏威夷,厄瓜多尔,新西兰和澳大利亚。 2.苦瓜的起源 Decker-Walters(1999)和Marr等(2004) 认为,亚洲是苦瓜可能的起源区域。 Schaefer等(2010)认为,苦瓜起源于非洲。 所以,对于苦瓜栽培种Momordica charantia L.的起源中心尚未定论。 3.苦瓜的分类 (1)形态学分类 (我国)分为白苦瓜、绿苦瓜;或者油瓜(滑身 苦瓜)、大顶苦瓜和珍珠苦瓜。 (2)分子生物学聚类 利用RAPD和SRAP分子标记技术,并不能获得与形态学分类一致的结果。 43个苦瓜种质UPGMA聚类图 三、苦瓜种质资源研究设想 1.苦瓜种质资源的收集 已经收集的苦瓜种质资源: 来自印度的31份,越南的16份,泰国的13份,菲律宾的13份,孟加拉国11份,尼泊尔的9份,柬埔寨的4份,印度尼西亚的3份,马来西亚的3份,老挝的1份,斯里兰卡的1份,斐济的1份,非洲坦桑尼亚的1份,南美洲Belize的1份;台湾的4份和国内大陆的68份。 总共收集了来自国内外的苦瓜资源180份。 2.苦瓜全基因组测序 苦瓜de novo测序材料 构建遗传图谱的另一苦瓜材料 × 3.苦瓜不同种质材料的重测序 对已经收集的180份苦瓜种质资源开展重测序分析。 通过对苦瓜进行de novo和重测序,目的是 (1)构建苦瓜全基因组草图; (2)开发苦瓜全基因组范围的SSR和InDel标记; (3)开展苦瓜植物学性状和农艺性状与基因组的关联分析并初步
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