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野生桂花的遗传多样性和遗传结构研究
园 艺 学 报 2014,41(7):1427–1435 http: // www. ahs. ac. cn
Acta Horticulturae Sinica
E-mail: yuanyixuebao@126.com
收稿日期:2014–03–04;修回日期:2014–05–16
基金项目:国家自然科学基金项目31160043);国家科技支撑计划项目(2012BAC11B02);江西省教育厅科技计划项目
(GJJ2241)
* 通信作者 Author for correspondence(E-mail:dmf.625@163.com)
野生桂花的遗传多样性和遗传结构研究
胡 菀1,2,罗 意2,阳 亿2,张志勇2,范邓妹2,*
(1江西农业大学林学院,南昌 330045;2江西农业大学,亚热带生物多样性实验室,南昌 330045)
摘 要:利用细胞核微卫星(nuclear microsatellite,nSSR)标记对中国4个省的7个野生桂花[
Osmanthus
fragrans
(Thunb.)Lour.]群体139个个体的遗传多样性和遗传结构进行了研究。11个微卫星位点揭示了
野生桂花等位基因多样性(
A
)平均为6.039,有效等位基因数(
N
e)平均为3.769,平均预期杂合度(
H
e)
为0.673。所有群体均显著偏离哈温平衡,近交系数
F
IS介于0.313 ~ 0.580之间。群体间遗传分化系数
F
ST =
0.143,AMOVA分析表明群体间遗传分化占总遗传变异的12.69%,群体内的遗传变异为87.31%。Mantel
检验表明野生桂花群体间遗传距离与地理距离不存在相关性(
r
=–0.277,
P
= 0.214)。STRUCTURE聚类
分析显示,所有个体被划分为3个理论群体,庐山群体和浏阳群体中谱系较为单纯,而其他群体则存在
一定程度的遗传混杂。瓶颈效应分析显示,除浏阳群体外所有群体经历了种群衰退。
关键词:野生桂花;微卫星标记;遗传多样性;遗传结构
中图分类号:S 685.13 文献标志码:A 文章编号:0513-353X(2014)07-1427-09
Genetic Diversity and Population Genetic Structure of Wild Sweet
Osmanthus Revealed by Microsatellite Markers
HU Wan1,2,LUO Yi2,YANG Yi2,ZHANG Zhi-yong2,and FAN Deng-mei2,*
(1
College of Forestry
,
Jiangxi Agricultural University
,
Nanchang
330045,
China
;2
Laboratory of Subtropical Biodiversity
,
Jiangxi Agricultural University
,
Nanchang
330045,
China
)
Abstract:Genetic diversity and genetic structure of 139 individuals from seven wild populations of
Osmanthus fragrans
in four provinces of China were studied with nuclear microsatellite(nSSR)markers.
A relatively high level of genetic diversity was detected in
O
.
fragrans
with 11 polymorphic microsatellite
loci. Average Allelic diversity(
A
),effective number of alleles(
N
e)and mean expected heterozygosity
(
H
e)were 6.039,3.769 and 0.673,respectively. All populations deviated from Hardy-Weinberg
equilibrium significantly,with inbreeding coefficient(
F
IS)rang
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