影响猪肢蹄结实度主效基因的克隆及其在猪育种中的应用可研报告.doc

影响猪肢蹄结实度主效基因的克隆及其在猪育种中的应用 ——可行性研究报告 一、研究的必要性 猪 我国是一个养猪大国，存栏量和出栏数都居世界首位。猪肉消费占我国肉类消费的60%以上，养猪业的发展，直接影响我国人民的膳食结构。由于饲料工业的发展，饲养管理的不断完善，我国养猪业进入了一个前所未有的发展阶段。但是我国养猪业发展仍然受到疫病的 肢蹄病随着猪生产集约化不断提高，种猪和商品猪肢蹄给养猪生产带来巨大的经济损失。Webb等(1983)和Sternbergen(1989)报道，在经过种猪性能测定的后备公猪中，有20%—50%的公猪是因为肢蹄存在问题而被淘汰。。采用传统的防治措施，需要投入大量的人力物力，而且效果。最佳的解决途径是通过遗传改良提高的肢蹄结实度培育抗病品系的遗传背景猪肢蹄病的抗病于刚起步阶段，只有英国罗斯林研究所G. J. Lee领导的研究小组开展的相关工作。他们通过大白猪和梅山猪杂交产生的F2代分离群体，把影响肢蹄评分的定位在1、13、14和15染色体上。 课题组经过5年的努力，已经完成了用于基因定位和分离的白色杜洛克和二花脸资源家系群体，共采集1918个F2代个体的样品。对其中的1809个F2代个体的肢蹄结实度进行了评分。通过对其中的457个个体的QTL定位分析，在1号和13号染色体上找到了2个影响猪肢蹄结实度的QTL（均达到基因组5%的显著水平）。二、技术方案 项目技术关键点或创新点，项目完成时达到的技术水平 1）、项目技术关键点或创新点： 利用连锁不平衡分析和IBD分析，精细定位猪肢蹄结实度主效基因的技术； 鉴别猪肢蹄结实度主效基因的因果突变，由此建立分子育种新技术 2）、项目完成时达到的技术水平 国际先进水平 技术方案：生产技术、工艺流程、主要技术参数； 1QTL精细定位：根据本课题组已有的猪肢蹄结实度QTL定位结果，在猪1号和13号染色体LOD值最高的QTL区域，增加4~6个标记，使标记密度达到每3 cM一个标记，对1809个F2个体进行QTL的精细定位，把QTL的区域缩小到6~10 cM。 2）、连锁不平衡和IBD分析：在10 cM的QTL区域内，开发6~8个SNP标记。检测1809个F2个体这些SNP的基因型，并进行连锁不平衡分析和IBD分析，把QTL的区域缩小到3~5 cM。 3）、位置候选基因研究：通在3~5 cM的QTL区域内，根据比较基因组，在人类同源区域内，寻找与骨骼形成或钙的代谢相关的基因，作为候选基因。对选定的候选基因进行克隆、测序，并检测候选基因中的突变位点，通过关联分析，寻找控制肢蹄结实度的主效基因的因果突变。4）、主效位点的鉴定：在本项目的合作单位——江西冬冬繁育有限公司选择肢蹄结实度表现极端的个体，对因果突变位点进行基因型检测，并对表型和基因型进行关联性分析，在商业群体中验证资源家系中的分离结果。5）、专门化品系选育：利用研发的分子育种新技术，在合作猪场选育核心群300头母猪的高肢蹄结实度的专门化新品系。 项目技术质量指标：项目产品达到的主要技术性能指标、执行的质量标准、通过的国家相关行业许可认证等；核心群300头母猪的高肢蹄结实度的专门化新品系4、阶段目标 1）、2007.1-2007.12大群体的QTL定位：完成17头F0，69头F1和1809个F2个体151个微卫星标记的检测和大群体的QTL定位工作； 2）、2008.1-2008.9主效基因因果突变的鉴定：通过连锁不平衡分析、IBD分析和位置候选基因的方法，完成主效基因的因果突变位点的寻找； 3）、2008.9-2009.12分子育种体系的建立及专门化品系的培育：完成抗肢蹄病分子育种体系的建立，并在合作猪场培育一个抗肢蹄病的专门化品系。5、项目经费预算情况表一项目投资与资金筹措表 单位：万元 序号 项 目 金 额 1 投资总额 32.0 固定资产投资 0.0 流动资金 32.0 2 资金筹措 32.0 自筹资金 0.0 其中：已完成投资 0.0 新增投资 0.0 申请科技三项经费 32.0 借（贷）款 0.0 表二项目拟购设备清单 序号 设备名称 规格型号 单 位 数量 单价 (万元) 金额 (万元) 表三申请科技三项经费使用预算表序号 名 称 单位 数量 金额(万元)使用时间 1 开发费 项目开发人员费 2 1.0 2007.8 原材料动力费 检测费 批 3 1