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第 一 节基本概念与原理 基因表达的产物 Proteins and polypeptides RNAs (mRNA, tRNA, rRNA etc) (四)终止子(terminator) 提供转录停止信号的DNA序列 原核生物 (与回文序列有关) 上海自来水来自海上 1、依赖于rho(?):与RNA聚合酶结合,阻止RNA 聚合酶越过终止信号使转录停止,并与RNA自 DNA模板解离有关。 2、不依赖rho(?)(简单的终止子):回文区富含 G-C序列使RNA形成发夹结构,终点前一系列U (6个),使RNA-pol脱离模板。 依赖于rho(?): (五)隔离子 真核基因组内能限定独立转录活性结构域的DNA元件 转录起始前复合物 (pre-initiation complex,PIC) 结构域与基序 结构域(Functional domains) 大分子内部相对独立并与其功能特性相关的结构单位。 基序(motifs) 具有功能意义的亚(小)结构域。 二级结构的聚集体(超二级结构) 由约30个氨基酸残基组成,序列特征为:Cys-X2-5-Cys-X12-His-X2-5-His。由12个残基构成的α-螺旋,靠Zn2+与相对的β-折叠结构相连。其连续存在的锌指模体识别螺旋位于DNA的大沟 Ⅱ类锌指蛋白 4、 “溴”结构域 (bromodomain) 异半乳糖(allolactose) 色氨酸操纵子 阿拉伯糖操纵子(双向调节) 第 六 节 真核基因转录调节 (四)基因不连续性 二、真核基因表达多级调控 染色体水平DNA的活化 转录的起始 hnRNA 的剪切和加工 mRNA 转移到胞浆 翻译 三、RNA pol I 和pol Ⅲ的转录调节 RNA pol I转录产物只有rRNA前体,有2个顺式作用元件(-45~+20bp核心元件,-156~-107bp上游控制元件UCE),需两种转录因子来正确有效地帮助起始转录(上游结合因子1和选择性因子1)。 RNA pol Ⅲ对tRNA和5S rRNA基因的转录调节,启动子在转录区内。 tRNA有2种转录因子, 5S rRNA有3种转录因子,但都只有TFⅢB才是真正的转录起始因子,在定位RNA pol方面起重要作用。 四、RNA pol II转录起始的调节 1. 由10-12个亚基组成 2. 最大亚基的C末端含有可磷酸化位点的T氨基酸残基(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser)重复序列,称为 CTD(Carboxyl Terminal Domain) 3. CTD是TFII-H的底物,磷酸化后与RNA链延伸有密切关系 五、RNA pol II转录终止的调节 HIV基因组转录终止调节 病毒蛋白Tat是一抗终止蛋白,它与转录产物5’端特异RNA序列结合,并与宿主蛋白质、RNA pol II相互作用,使延长中的RNA形成一定的二级结构,阻止HIV基因组转录提早终止 六、转录后水平的调节 (一)hnRNA加工成熟的调节 在核内进行加工修饰,包括加帽、加尾、剪接、碱基修饰和编辑等。 (二)mRNA运输、胞浆内稳定性的调节 1. mRNA的自身的特异序列与相关的调节蛋白相互作用 2.小分子RNA (dsRNA) 七、翻译水平的调节 主要的调节点:起始阶段和延长阶段 (一)翻译起始因子(eIF)活性的调节 磷酸化可阻碍eIF的正常功能 (二)RNA结合蛋白(RBP)对翻译起始的调节 铁浓度低时,阻碍小亚基与其始点结合,抑制翻 译起始; 铁浓度高时,翻译起始。 强诱导剂: IPTG IPTG:isopropyl-?-D-thiogalactoside 异丙基-?-D-硫代半乳糖苷 cAMP结合位点 DNA结合域(HTH) CAP :catabolic activator protein CAP与cAMP的结合,使DNA结合域得以暴露 cAMP-CAP与CAP位点的结合,使DNA双螺旋链稳定性降低,有利于RNA聚合酶与启动子的相互作用 (三) CAP的正性调节 CAP 无葡萄糖,cAMP浓度高时 有葡萄糖,cAMP浓度低时 CAP 葡萄糖对cAMP浓度的调节主要是葡萄糖代谢产物G-6-P抑制AC(腺苷酸环化酶)的活性,激活磷酸二酯酶,而使cAMP生成减少。 (四)协调调节 单纯乳糖存在时,细菌利用乳糖作碳源; 若有葡萄糖或葡萄糖/乳糖共同存在时, 细菌首先利用葡萄糖。 mRNA 低异乳糖时 高异乳糖时 葡萄糖低
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