中国汉族人群转生长因子β1和β3基因多态性与高度近视的关联研究.pdf

中国汉族人群转化生长因子Ijl1和D3基因多态性与 高度近视的关联研究 中文摘要 目的：研究中国汉族人群转化生长因子B1和D3与高度近视关联的位点，揭示 与高度近视相关的发病环节． 材料和方法： 本研究采取病例．对照关联分析，随机选取300名高度近视(要 求近视度数§8．00D)，及300名无相关的对照样本(要求双眼屈光不正在十，．O．75D 因型数据，输入H印loview4．0，设置标准，选取标签S№在TG邛l的数据中加 入第一外显子第十编码子上的多态性位点同时进行检测。软件分析后选定标签 SNP进行基因型的检测．在基因型检测方法选择上，以经典的PcR-RFLP作为 基础方法，选择位于内切酶酶切位点的sNP进行RFLP以区分不同基因型．对 段长度多态性(RFLP)测定病例一对照样本中多态性位点的基因型；以引物延伸 点的基因型；选择等位基因特异性实时荧光定量聚合酶链反应测定体2241716和 基因型．对于TGFB3 时荧光定量聚合酶链反应测定基因型。根据样本所得各sNP基因型，计算其基 因型与等位基因的频率；采用卡方检验比较病例．对照组之间基因型与等位基因 频率分布的差异，采用HAPLOvIE、Ⅳ．4．o进行标签sNP的连锁不平衡分析及单体 型分型与比较。 本不符合H砌y-w西nberg平衡，样本不具群体代表性而被排除统计．其余的七 型频率与等位基因频率的无显著性差异，提示这三个位点与高度近视无明显关 病例．对照组之间基因型频率与等位基因频率的显著性差异，提示这四个sNP与 高度近视具有显著关联．进一步进行这七个sNP的连锁不平衡分析与单体型分 强LD．单体型TCGG，唧病例．对照之间有显著性差异．wald检验结果显示 科803455可能是实际起作用的多态性位点． 第二部分：对于TGFp3，选定八个标签s忡进行基因型的检测。结果显 示，倦39172lo由于基因型结果变异大，可重复性差，且对照组样本不符合 均符合Hardy-weinberg平衡，样本具群体代表性。在对单个位点的关联分析发 现，七个标签sNP中，除璐391720l外，其余六个位点的病例一对照组之间基因 型频率与等位基因频率均无显著性差异；提示这六个多态位点与高度近视无明显 关联；而昭3917201病例一对照组之间基因型频率与等位基因频率均有显著性差异 (po．05)，提示与高度近视可能存在关联，但多重矫正分析排除了该位点的显 2 著性． 结论：采用候选基因策略，检验了高度近视候选基因TG邓1和TGFD3与高度 近视的关联性．预先通过HAP脚数据库选取了两个候选基因内的标签多态位 点sNPs，然后收集了高度近视组与正常对照组，并在其中进行基于病例．对照的 关联分析．关联分析提示TGFp3可能与高度近视无关联；而TGFpl的四个位点 的阳性结果提示这个基因极有可能与高度近视有关联，需要进一步加大近视眼家 系样本量及遗传标记位点的密度来加以确证． 关键词：高度近视；单核苷酸多态性；转化生长因子；关联分析 Associationof Nucleotide in StlldySingle PoIymorphisms 1and Geneswith TGFpTGFl313 highmyopia Abstract fhldme嬲sociatedSNPsin l觚d iIl Purposes：t0 TGFB TGFB3谢tlllli曲myopia orderto tlle of le锄the删yetiologylli曲myopi乱 Methods：C觞咖n．ol鹊sociationinme stIl坤w蠲llSedr销∞rCh．R趾domly choose to0r 300no肌al 300 lli