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十二指肠钩虫锰氧化物岐化酶(admn-sod)的生物信息学分析、表达及其活性研究
十二指肠钩虫锰超氧化物岐化酶(AdMn.SoD)的生
物信息学分析、表达及其活性研究
摘 要
【目的】
本论文在课题组前期分离获得十二指肠钩虫锰超氧化物岐化酶
信息学分析;进一步构建AdMn.SOD成熟蛋白原核表达系统,在大肠杆菌
度、pH值对活性的影响。研究结果将为进一步研究AdMn.SoD的生物学功能并
探讨其应用奠定基础。
【方法】
1.AdMn-SOD的生物信息学分析
运用生物信息学软件DNAS吖皿及DN触以AN分析前期获得的AmI.SOD
基因序列的阅读框(OI谭);运用在线软件Si铲alIP3.0及TargetPprogram
细胞定位;运用在线生物信息学软件BLAST有哪些信誉好的足球投注网站An由叶SOD基因序列及其推
AdMn.SOD的功能域;运用CUJSTALW程序比对分析An缸.SOD与其它已报
道线虫及部分代表性物种的Mn.SOD氨基酸序列;运用MEGA3.1软件中邻近
法(I溉gll_bor-joining
它线虫及部分代表性物种Mn.SOD的进化树关系。
2. AdMn-SOD的原核表达
I和
设计引物,扩增Ad№.SOD成熟蛋白编码序列,扩增产物经M
Z砌饥II双酶切后与表达载体pET.32a连接,构建重组原核表达重组质粒。将构建
导表达,SDS.PAGE分析表达情况。
3.重组AdMn-SOD的活性检测
诱导表达的重组蛋白用Ni亲和层析进行纯化,用Bradf.0rd法测定纯化蛋白
的浓度,用超氧化物岐化酶检测试剂盒wsT-l检测重组蛋白AdMn.SOD的超氧
化物抑制百分率,测定其酶活性的单位,并分析温度、pH值对活性的影响。
【结果】
1. AdMn.SOD的生物信息学分析
推导AdMn-SOD
肽。AdMn.SOD包含有保守的与锰离子结合的3个组氨酸残基及1个天冬氨酸残基
构。AI舭卜SOD前端20个氨基酸残基组成信号肽序列,第2l一216个氨基酸序列为
其蛋白序列;经用Targ卯预测,AdMn.SOD位于线粒体中。
用BLASTN及BLASTP程序在GellBank中检索相似性序列,结果显示
Ad№.sOD基因序列及其推导的编码蛋白与秀丽小杆线虫、罗氏沼虾
Ⅲ删砒幽f删脚明6孵的及中国对虾(砌刀e唧册口邮幽加伽话)等线粒体
M小SOD具有较高相似性。与其它线虫及部分代表性物种的Mn.SOD氨基酸序列
亲缘关系较近。
2. AdMn-SOD的原核表达
运用RPPCR技术扩增获得了AdMn-SOD的成熟蛋白编码序列,并成功构
建了pET32a/Ad№.SOD原核表达重组质粒。构建好的重组表达质粒
的重组AdMnSOD可溶性目的融合蛋白量达44.4nlg/IIll。
3.重组AdMn.SOD的活性检测
mg。pH值在6.5和9.5之间对其活性影响不大,其最适pH为8.5;随温度的升
高,其活性逐渐降低,在90℃仍存在40%以上活性,因此可知重组AdMn.SOD
对温度有较好的耐受性,在较高温度仍具有较好的酶活。
2
【结论】
Mn.SOD亲缘关系较近,与其他生物种Mn.SOD序列也具有较高相似性;成功
AdMn.SOD具有较好生物活性,结果为进一步研究AdMn.SOD的生物性功能和
特性奠定了基础。
【关键词】:十二指肠钩虫,锰超氧化物岐化酶,生物信息学,原核表达,活性,
pH,温度
Bioinformatic and Ancylostoma
acti、ri锣of
analysis,expression
duodenale
manganesesuperoxide
Abstract
Objective
To bioinformaticsofme dismut勰e
a11alyze predictedmaIlg髓ese哪I锄xide
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