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应用selditof-ms筛选淋巴瘤血清生物标志物及建立人工神经网络诊断模型的研究
应用SELDI-TOF-MS筛选淋巴瘤血清生物标志物及建立人工
神经网络诊断模型
摘要
目的:由于淋巴瘤小病灶、早期局限病灶检出率较低,同时对于
病灶隐匿或处于机体深部而患者不能耐受或不愿手术取组织活检的,
给临床诊断造成极大的困难。我们利用SELDI技术对淋巴瘤患者和正
Wizard
常对照的血清蛋白质进行检测,通过Biomarker3.1系统软件对
蛋白质丰度和质荷比(M/S)进行分析,期望筛选出可用于临床淋巴
瘤诊断的特异性血清生物标记,并进一步对淋巴瘤患者和正常对照及
其非淋巴瘤组之间(淋巴结炎和其它肿瘤)有显著差异的血清蛋白质
峰进行优选,建立数据库,结合人工神经网络(ANN)建立诊断模型,
从而突破传统的应用组织活检才能确诊淋巴瘤的技术瓶颈。方法:运
清,用AU蛋白芯片获得血清蛋白表达指纹图谱,并用Biomarker
Wizard
3.1软件对检测数据进行分析,得到的数据进行初步的统计学
分析(计算均值i、尸值和标准差S),PO.05被认为差异具有统计学
意义。从淋巴瘤组和非淋巴瘤组及其正常对照之间(淋巴结炎和其它
肿瘤)血清蛋白质指纹图谱的具有明显差异的质荷比中,优选特征性
蛋白质,应用BP人工神经网络建立淋巴瘤神经网络诊断模型。结果:
人对照的血清蛋白质指纹图谱比较分析,发现差异表达的76个蛋白质
13个蛋白质峰在淋巴瘤患者血清中高表达,有6个蛋白质峰在淋巴瘤
患者血清中低表达;(2)有11个蛋白质峰在淋巴结炎患者血清中高表
达,有7个蛋白质峰在淋巴结炎患者血清中低表达;(3)有12个蛋白
质峰在其他肿瘤患者血清中高表达,有4个蛋白质峰在其它肿瘤患者
血清中低表达;(4)有5个蛋白质峰在两个病例组呈现高表达(淋巴瘤
和其它肿瘤);有7个蛋白质峰在三个病例组中均呈现高表达(淋巴结
炎,淋巴瘤及其它肿瘤),有5个蛋白质峰在三个病例组中均呈现低表
达(淋巴结炎,淋巴瘤及其它肿瘤);有一个蛋白质峰仅在淋巴瘤中
呈现低表达。(5)筛选出9种对淋巴瘤诊断鉴别有意义蛋白;其中有6
个在淋巴瘤血清中高表达,高表达的蛋白质M/Z分别是4218,4966,
瘤的灵敏度87.7%,特异度98.1%,诊断准确率97.4%,阳性预测值
81.8%,阴性预测值98.6%。结论:本实验研究结果表明:1.淋巴瘤患
者与非淋巴瘤患者及其正常对照者血清中蛋白质的表达具有明显的
差异性;2.筛选其中差异表达的蛋白质标记物建立预测模型,为淋巴
寻找淋巴瘤患者血清学生物标志物和诊断淋巴瘤的有效工具。
关键词:淋巴瘤; 表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱;
蛋白质组学; 生物标志物; 人工神经网络
biomarkersSELDI—-
of serum by
Studyscreeninglymphoma
TOF—MSand model
establishinglymphomadiagnostic
theartificialneuralnetwork
through
tosmalllesionsand limitationofthe
Abstract:Objective:Dueearly
lesionsdetectionrateis thesame occult
lymphoma,the low,At time,the
lesionsorlesionsthathiddeninthe and cannot
deep body patients
tolerateor to theenormous
unwill
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