第七章细菌的分类与命名精要.ppt

第七章 细菌的分类与命名 细菌分类学是对细菌进行分类、命名与鉴定的一门学科。任务是在全面了解细菌生物学特征 的基础上，研究它们的种类，探索其起源、演化以及与其他类群之间的亲缘关系，进而提出能反映自然发展的分类系统，并将细菌加以分门别类。它包括分类、命名和鉴定三个方面。 一、基本概念 1．细菌分类 根据细菌各自的 特征，并按照亲缘关系分类， 以不同等级编排系统。分类 有两种： ①细菌的生理生化分类法，包括 有传统分类法和数值分类法； ②细菌核酸、蛋白质结构的同源 程度进行分类法，称种系分类 或自然分类。 2．细菌命名 在分类基础上，给 每种细菌一个科学名称，便于 交流并保证所有的科研工作者 给予同样名称。 3．细菌鉴定 将未知细菌按分 类原则,确定细菌的分类地位。 二、分类等级 1.细菌的分类等级依次为界、门、纲、 目、科、属、种。细菌属于原核生 物界，包括有细菌、放线菌、支原 体、衣原体、立克次体和螺旋体。 分类等级表示方法如下：目、亚目、 科、亚科等。 2.种是细菌分类的基本单位，将生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属；相近的属归为一科；依次类推。在两个等级之间，可添加次要的分类单位，如亚门、亚纲、亚属和亚种等。群和组不是正式分类等级，具有某种共同特性的某个集体，任何等级都可借用。 3.同一菌种在某些方面仍有差异， 可再分成亚种，亚种以下的分类等级为 型，以区别某些特殊的特征。例如抗原 结构不同而分的血清型；对噬菌体敏感 性不同的噬菌体型；对细菌素敏感性不 同的细菌素型，生化反应和某些生物学 性状不同的生物型。 4.由不同来源分离的同一种、同一亚种或同一 型的细菌，称为株。株是从一次单独分离物 的单个原始菌落传代的纯培养物，例如从10 个肺结核患者的痰液中分离出的10株结核分枝 杆菌。具有某种细菌典型特征的菌株称为模式 菌或标准菌株，它是该种菌株的参比菌株。在 细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌为依据， 也可作为质量控制的标准。 三、细菌命名法 细菌的学名的生物双名式，具备拉丁 化文字形式和明确分类等级的两个特点， 即有一个属名和一个种名构成。属名在 前，是名词，首字母大写；种名在后， 是形容词，均用小写；两者均用斜体表 示。细菌学名的中文译名则种名在前， 属名在后。 例如Salmonellatyphi(沙寒沙门菌)。 属名也可用第一个字母代表，如S typhi 等。有时泛指某一属细菌而不特指其中 的某个细菌则可在属名之后加上sp， 如Salmonella sp，即表示沙门菌属细 菌(sp代表菌种species，复数用spp)； 如果使用1个亚种的名称，则在种名 后再加亚种名如Klesbsiella penumomae subspecies pneumomae。 细菌的分类方法 一、生理学与生化学分类法 细菌的形态、染色以及特殊结构是 最早的分类依据，方法有传统分类 和数值分类法两种。 1．传统分类法 19世纪以来，以形态 生理特征为依据选择稳定的生物学 性状，如形态结构、染色性、培养 特性、生化反应、抗原性作为分类 依据，然后按主次顺序逐级区分。 使用方便，分类亦明确，但有主观 性。 2．数值分类法 20世纪60年代，随计 算机的应用而发展的分类方法。它 对各种生物学性状按“等重要原则” 进行分类，选用50项以上的生理生 化指标进行比较，分析相似度，划 分属和种，并确定亲缘关系。 二、遗传学分类法 遗传学分类是以细菌的核酸、 蛋白质等组成的同源程度分类。 该分类法的优点是： ①对细菌的“种”有较为一致的概念； ②使分类不会出现根本性的变化； ③可制定可靠的细菌鉴定方案； ④有利于了解进化和亲缘关系。 基因型分类法有如下几种: 1．DNAG+C mol％测定 DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为 100，测定其中G+C或A／T摩尔百分比，能反映 出细菌间DNA分子同源程度，习惯上以G+C作为 细菌分类标记。不同菌属间的G+C mol％范围 很大，在25％—75％之间，但同一种细菌G+C mol％相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他 外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们 G+C mol％越相近。 2．核酸同源值测定 利用DNA分子杂交技术测定DNA分子的相 似度。其步骤是先提取DNA，加热变性解 链,然后将两种变