血清白蛋白序列中的相似氨基酸突变特点分析.pdfVIP

第 １３卷 第３期 生 物 信 息 学 Ｖｏｌ．１３ Ｎｏ．３ 　 　 　 　 　 　 　 　 　 　 ２０ １５ 年 ９ 月 Ｃｈｉｎｅｓｅ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ｓｅｐ． ２０１５ － ｄｏｉ：１０３９６９／ ｊ．ｉｓｓｎ．１６７２ ５５６５．２０１５．０３．０６ 血清白蛋白序列中的相似氨基酸突变特点分析 １∗ ２ ２ ２ ２ ３ 陆会宁 ，齐燕姣 ，冯树华 ，李世玺 ，赵娅敏 ，金能智 （１． 西北民族大学生命科学与工程学院，兰州 ７３０１２４； ２． 西北民族大学化工学院，兰州 ７３０１２４； ３． 甘肃省计算中心，兰州 ７３００００） 摘　 要：血清白蛋白是必不可少的生命物质，在生命运动和发展延续中起着重要的作用。 它不仅能维持正常的血浆渗透压， 最重要的是能够储存和运输众多的内源性和外源性物质。 本文利用生物信息学的方法分析了几种不同物种的血清白蛋白的 结构信息和疏水性特点，研究表明人、牛、猴、兔、狼、猫的血清白蛋白序列均属于亲水性蛋白质，在 １００ ｂｐ 以内的疏水性值差 别比较明显。 通过对血清白蛋白进行多序列比对分析，发现兔血清白蛋白的氨基酸突变的数目是最多的。 在这几种血清白 蛋白序列中，氨基酸突变更容易发生在结构相似、极性相似和能量比较接近的氨基酸之间，如Ｄ和Ｌ、Ｅ 和Ｄ。 对于人血清白 蛋白来说，从疏水性的丙氨酸Ａ到酸性的谷氨酸Ｅ 的突变比较多，使得人血清白蛋白在进化过程中的亲水性增强，是个很好 的储存和运输小分子的载体。 这些基于生物信息学方面的血清白蛋白的突变及其进化关系的研究，为进一步研究药物与血 清白蛋白的相互作用在其他物种中表现和特点提供了良好的基础。 关键词：血清白蛋白；序列比对；突变；疏水性 － － － － 中图分类号：Ｑ ０３　 　 文献标志码：Ａ　 　 文章编号：１６７２ ５５６５（２０１５）０３ １７９ ０７ Ｍｕｔａｔｉｏｎａｌ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆ ｔｈｅｓｉｍｉｌａｒａｍｉｎｏａｃｉｄｏｆ ｓｅｒｕｍａｌｂｕｍｉｎｓｅｑｕｅｎｃｅｓ １∗ ２ ２ ２ ２ ３ ＬＵ Ｈｕｉｎｉｎｇ ，ＱＩ Ｙａｎｊｉａｏ ，ＦＥＮＧ Ｓｈｕｈｕａ ，ＬＩ Ｓｈｉｘｉ ，ＺＨＡＯ Ｙａｍｉｎ ，ＪＩＮ Ｎｅｎｇｚｈｉ （１． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ａｎｄ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｎｏｒｔｈｗｅｓｔ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ，Ｌａｎｚｈｏｕ７３０１２４，Ｃｈｉｎａ； ２． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｎｏｒｔｈｗｅｓｔ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙｆｏｒ Ｎａｔｉｏｎａｌｉｔｉｅｓ，Ｌａｎｚｈｏｕ７３０１２４，Ｃｈｉｎａ； ３． ＧａｎｓｕＰｒｏｖｉｎｃｅ Ｃｏｍｐｕｔｉｎｇ Ｃｅｎｔｅｒ，Ｌａｎｚｈｏｕ７３００００，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｓｅｒｕｍ ａｌｂｕｍｉｎ ｉｓ ｅｓｓｅｎｔｉａｌ ｔｏ ｌｉｆｅ ａｎｄ ｐｌａｙｓ ａｎ ｉｍｐｏｒｔａｎｔ ｒｏｌｅ ｉｎ ｔｈｅ ｌｉｆｅ ｍｏｖｅｍｅｎｔ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ． Ｉｔ ｃａｎ ｎｏｔ ｏｎｌｙ ｍａｉｎｔａｉｎ ｎｏｒｍａｌ ｐｌａｓｍａ ｏｓ