绵羊皮肤UniGene 数据库其功能分析.docVIP

绵羊皮肤UniGene数据库及其功能分析 张文广1，2 3，张燕军1，高爱琴1 3，吴江鸿1，3，常子丽1，2，武瑞兵1，丽春1，李金泉1 3,* 1内蒙古农业大学动物科学与医学学院，呼和浩特，010018 2内蒙古ATCG生物信息研究所，呼和浩特，010020 3内蒙古自治区动物遗传育种与繁殖重点实验室,呼和浩特, 010020 摘要 为了辅助羊毛性状的分子机理研究，以期找到控制羊毛性状的基因，内蒙古农业大学和内蒙古ATCG生物信息研究所对目前国际上发表的在绵羊皮肤中表达的基因作了系统总结，构建了绵羊皮肤和毛囊相关基因的数据库和透视分析工具。该数据库包含6360个UniGene及其对应表达序列标签（EST）的超级链接和电子差异显示分析。这一数据库及其分析工具可以为深入研究毛嚢发生的分子机理奠定基础，帮助研究人员开展绵羊皮肤毛囊相关候选基因的研究与产毛性状QTL的关联分析。 Bioinformatics pivotdata for UniGene analysis in wool sheep skin Zhang Wenguang1,2, Zhang Yanjun1, Gao Aiqin1, Wu Jianghong1,2, Chang Zili1,2, Wu Ruibing1, Li Jinquan1,* 1 College of Animal Science and Medicine, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot, 010018 2 Institute of ATCG, Nei Mongol Bio-Information, Hohhot, 010020 Abstract The Bioinformatics group at the Inner Mongolia Agricultural University and Institute of ATCG, Nei Mongol Bio-Information is developing bioinformatics tools and resources for scientists engaged in gene analysis in fur-bearing animals. The pivotdata developed encompass both the UniGene database and the associated analytical tool required for differential expression profile of sheep skin. The pivotdata has now been fully implemented for sheep unigene data including 6360 UniGene cluster. We have also developed a hyperlink to capture statement that specific UniGene and related expressed sequence tags (ESTs) and digital differential display (DDD). This pivotdata contains candidates of interest for further investigation into the molecular control of wool follicle development and could be used for quantitative trait locus (QTL) associated study. 第一作者，张文广（1973-），副教授，研究方向为，动物遗传育种与生物信息学。Email： atcgnmbi@。*通讯作者，李金泉（1957-），教授，研究方向为，动物遗传育种。电话：0471-4309195。  我国是个养羊大国，2005年我国存栏羊总数为3.73亿只，饲养量位居世界第一，其中绵羊17.4亿只，占总数的46.66%[1]。近年来，国内外毛纺产品已经向轻薄、柔软、挺括、高档方向发展，世界羊毛生产及贸易突出的变化是超细型羊毛需求增加。因此，加快超细细毛羊品种选育是世界细毛羊育种工作的重点。绵羊大多数产毛经济性状都是中度遗传的，长期以来，人们培育了数以百计的品种和品系。常规育种的遗传进展进展缓慢，一般不足5%。人类基因组和动物基因组研究的新成果不断激发广大畜牧科学工作者尝试通过标记辅助选择来提高遗传改良的速度，甚至完全寄希望于分子育种。因为理论上利用分子育种方法培育品种只需要较少的世代就可以完成，